基于TCGA数据库肿瘤免疫细胞浸润分析流程 / 开普饭

作者介绍 :本文作者大可,四川大学华西医院肿瘤中心科研搬砖工,研究兴趣包括机器学习在高维组学问题中的应用,预测模型的开发与验证.已发表多篇生信和机器学习相关sci文章. 编辑校稿:白介素2 各位朋友大 ...

Exploration of the immune-related signature and immune infiltration analysis for breast ductal and l ...

大家好,今天小编要和大家分享的是今年5月份发表在Theranostics(IF:8.579)上的一篇文章,"Macrophage correlates with immunophenotyp ...

The immune infiltration in clear cell Renal Cell Carcinoma and their clinical implications: A study ...

EP300 mutation is associated with tumor mutation burden and promotes antitumor immunity in bladder c ...

m 6 A regulator-mediated methylation modification patterns and tumor microenvironment infiltration c ...

今天给大家分享的是一篇发表在Int. Immunopharmacol (IF=3.361)杂志上的文章Prognostic biomarker MITD1 and its correlation wi ...

研究背景: 核糖核苷二磷酸还原酶亚基M2(RRM2)是核糖核苷酸还原酶的催化亚基,可调节酶活性,这对于DNA复制和修复至关重要.然而,RRM2在肺腺癌(LUAD)中的作用仍不清楚. 研究方法: 在这项 ...

文章:TIMER2.0 for analysis of tumor-infiltrating immune cells 肿瘤微环境中免疫细胞的组成和丰度强烈地影响着肿瘤的进展和免疫治疗的效果.由于直接 ...

GEPIA(http://gepia.cancer-pku.cn/index.html)这个工具可以说是分析TCGA数据库数据分析工具中比较简单好用的工具了,包括生存分析,表达差异分析,相关性分析等, ...

关于TCGA表达数据的分析.之前我们我们介绍过.目前可能用的最多的也就是GEPIA了.之前在GEPIA2发表的时候(GEPIA I, GEPIA II),我们对这个数据库进行了介绍.最近.GEPIA的 ...

让我们一起科研吧~ 小燕子肿瘤微环境是当前研究的一个热点,无论是国自然还是发SCI,都是比较热的点,那么,数据挖掘也不例外,很多人喜欢追随这样的热点.(肿瘤微环境是指肿瘤的发生.生长及转移与肿瘤细胞 ...

启帆精读 ZKQF 2018年宫颈癌占所有癌症相关死亡病例的3.3%.在20-39岁年龄组,宫颈癌是女性因癌症死亡的第2大原因.80%-90%的宫颈癌为鳞状细胞癌,宫颈鳞状细胞癌主要治疗方法为手术. ...

这两天"王院长"帮别人分析snv数据,顺便给我推荐了一个R包:maftools.我看了一下官网,感觉是个非常强大的R包.那必须要学习起来~实际上网上已经有很多教程了,但都是用maf ...

研究背景: 越来越多的证据表明,肿瘤微环境在肿瘤的发生和发展中起着重要作用,并且还可以影响患者的预后. 研究方法: 在这项研究中,我们通过分析肿瘤样品的免疫和基质评分以检测差异表达基因(,筛选了乳腺癌 ...

本文由Bayegy根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读明明测了100000条序列,为什么我用dada2得到的OTU丰度只有8000?是人性的扭曲还是道德的沦丧? ...

基于CNKI数据库的我国数学教材研究热点可视化分析教材是经国家.地方教育部门许可的,向每一代学生呈现人类知识和文化的权威版本,是课程的物化载体,是教与学的重要媒介,是教师组织学生学习活动的重要思路与 ...

基于TCGA数据库肿瘤免疫细胞浸润分析流程