使用biopython查询NCBI数据库 / 开普饭

环肽中,二肽是最小的结构了,由两个氨基酸首尾相连,此时氨基酸互换的话,结构是一样的,例如环二肽cyclo(Pro-Val)的结构和环二肽 cyclo(Val-Pro)的结构是一样的.环二肽在药代药动 ...

看到Amyloid β-Protein,第一反应就是和阿尔茨海默氏病有关,这类研究的相关肽种类已经有接近200种了,包括各种缺失肽,某位置氨基酸被替换的肽段(简称替换肽),局部片段肽,含有Met(O) ...

2,1 .过滤器的创建接上回讲到的内容,我们已经创建好了PubMed的账户,登录后可出现如下界面,点击My NCBI,可以看到界面中含有Search NCBI database(选择数据库点击Sea ...

目录如下: 生信人必学ftp站点之NCBI-GEO 脚本作业-解读NCBI的ftp里面关于人的一些基因信息 NCBI的taxid简单介绍 NCBI的基因entrez ID相关文件介绍请直接看我博客吧 ...

当我打开界面时,发现原先的PubMed数据库界面中出现如下弹窗,这意味着PubMed数据库更新了. 新的PubMed数据库网址从https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ ...

编号:83205 中文名称:Ac-DEVD-pNA 英文名称:Ac-DEVD-pNA CAS号:189950-66-1 单字母:Ac-DEVD-pNA 三字母:Ac-Asp-Glu-Val-Asp-p ...

转录组测序(RNA-Seq)是当下生物医学科研领域的热点技术,在SCI论文中频频亮相.但是无论是以RNA-Seq为试验主体的论文,还是以RNA-Seq为分析辅助手段的论文,在发表之前总是绕不开一个问题 ...

查询指定数据库中所有表 (指定数据库的,所有表) // 可以把 TABLE_NAME 换成 * 号, 查看更丰富的信息 SELECT TABLE_NAME FROM information_sc ...

似乎这几天我一直在吐槽这数据库,那数据库,这软件和那软件,其实这暗示了生物信息领域的常态.随着测序技术的飞速发展,二代测序变成常态,同时相应的软件也在逐渐跟上,测序的十年实在是发展太快了,宏基因组的分 ...

KEGG数据库称之为基因组百科全书,是一个包含gene, pathway等多个子数据库的综合性数据库.为了更好的查询kegg数据,官方提供了对应的API. 在biopython中,通过Bio.KEGG ...

前言有时候,需要在数据库中查询一些字段的具体信息,而这些字段又存在于不同的表中,那么我们如何来查询呢?在每一个数据库链接的information_schema数据库中,存在这样一张表--COLUMNS ...

NCBI 美国国家生物技术信息中心俗话说,民以食为天,而科研则以数据为天.NCBI作为大名鼎鼎的科研信息数据库,想来大家都耳熟能详,其功能更是强大到无微不至,因而,对该数据库的合理使用无疑会让科研汪 ...

一背景随着数据规模的不断扩大,用户SQL的执行时间越来越长,这不仅对数据库的优化能力提出更高的要求,并且对数据库的执行模式也提出了新的挑战.随着数据库在云上的蓬勃发展,越来越多的传统用户迁移到云 ...

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