HIV耐药基因简介
来源：小桔灯网
作者：山欸岖
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艾滋病与抗病毒治疗
艾滋病是威胁人类健康的头号传染性疾病，是一种由人类免疫缺陷病毒（HIV）所引起的。HIV是把人体免疫系统中最重要的CD4+T淋巴细胞作为主要攻击目标，进而会使机体免疫功能不断下降。因而HIV患者易于感染多种疾病，如不及时治疗控制病死率极高。
抗病毒治疗是艾滋病治疗的关键，“高效抗逆转录病毒治疗”（HAART）俗称“鸡尾酒疗法”，是通过三种或三种以上的抗病毒药物联合使用来治疗艾滋病。该疗法可以减少单一用药产生的抗药性，最大限度地抑制病毒的复制，从而延缓病程进展，延长患者生命，提高生活质量。
HIV是一个逆转录病毒，缺乏纠错功能，在病毒高速复制中，每天约10亿个新病毒产生，导致高突变和新病毒株不断产生。
抗病毒治疗以后如果没有好好吃药，不能完全控制病毒，在药物的存在下耐药株由于“适者生存”得到优势繁殖从而造成耐药。一旦产生耐药，原先使用的药物将失去抗病毒作用，所以，体内的病毒数量会越来越高，破坏人体的免疫力，导致艾滋病发病。并且在接受抗逆转录病毒治疗患者中，大约50%患者会发生一个以上主要的耐药性突变。
02
HIV耐药与检测
HIV耐药主要类型分类如下图
对于HIV耐药检测方法主要有表型耐药检测和基因型耐药检测两种。
表型耐药检测是基于体外培养技术，通过检测在药物存在情况下病毒的繁殖情况进而判断病毒的耐药程度。
基因型耐药检测是针对耐药相关基因进行扩增和测序的方法，利用耐药基因型解释系统来判断是否耐药以及耐药的程度。这也是目前最广泛的检测技术。
耐药基因的检测被用来指导临床医生治疗病人。
要检测耐药基因，我们首先得知道用于治疗的抗反转录病毒的药物有哪些，如下表
对于不同的药物，产生了不同的耐药基因，主要的耐药基因如下表
耐药基因检测需扩增HIV-1的pol基因区，至少应覆盖蛋白酶区4-99位氨基酸和逆转录区38-320位氨基酸区域。
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耐药结果分析
最终结果根据HIV-1耐药基因型解释系统来评判对特定药物的耐药程度。
目前提供HIV-1耐药基因型检测数据分析和解释系统的主要机构有：国际艾滋病协会、美国斯坦福大学、法国国家艾滋病研究署和比利时Leuven大学Rage医学研究所。
以美国斯坦福大学（https://hivdb.stanford.edu/）的为例
1是打开HIVdb Program
2选择突变分析，或者序列文件进行分析即可
斯坦福大学的耐药解释系统根据耐药突变位点得到某种药物的单分值，然后累计得到该种药物的总分值，按照总分值来判断耐药程度，0-9分为敏感（S），10-14分为潜在耐药（P），15-29分为低度耐药（L），30-59分为中度耐药（I），60分以上为高度耐药（H）。
最终就可以得出具体HIV患者的耐药基因与程度了。