2021.05在线数据库汇总

在 5月期间 ，总共发表了医学相关在线数据库52个。下面就来给大家介绍一下主要有哪些数据库，以及笔者比较感兴趣的数据库。如果想要所有相关数据库信息的，后台回复：2105。

疾病和药物相关数据库

在这个部分，一共发表了7个数据库 。其中有两个是和疾病有关的数据库(帕金森、乳腺癌、精神疾病和炎性肠病)。

另外，由于新冠疫情，大家现在基本上也知道了病毒疫苗是干啥的了。Vaxign2(http://www.violinet.org/vaxign2)是一个用来设计疫苗的数据库。利用这个数据库可以设计其他病毒或者物种的疫苗

还有，就是DREIMT(http://www.dreimt.org/)这个数据库。对于转录组数据而言，我们可以通过算法来计算样本的免疫细胞。之前的很多数据库，例如TIMER用来分析免疫细胞和基因的相关性的。而这个数据库则是来分析免疫细胞和药物的相关性的，用来寻找针对某一个免疫细胞的药物。

微生物和病毒相关数据库

在这个部分，总共发表了2个数据库 。

其中EDGAR3.0是一个比较微生物基因组的工具。在这个平台上可以比较基因在不同微生物基因组上的差异。

DNA相关数据库

在这个部分，总共发表了2个数据库 。其中有两个是研究点突变对于蛋白功能影响的数据库

剩下的那个，re-Searcher(https://nla-lbsb.nu.edu.kz/)是一个用来对VCF文件进行简单操作的工具。在基因组测序之后，我们就可以获得基因组上基因改变的情况的VCF文件。

但是对于没有一些编程基础的人而言，处理这些文件还是比较麻烦的，这个时候就可以使用这个数据库了。这个数据库可以对VCF文件进行简单的筛选。来获得我们想要的范围内的结果

RNA相关数据库

在这个部分，总共发表了8个数据库 。

其中DoChaP(https://dochap.bgu.ac.il/#!/)是一个用来可视化不同转录本结构域的数据库。我们在进行转录本研究的时候，由于其外显子区域的变化，很有可能引起这个基因不同转录本的结构域不同。这个数据库就可以可视化一个基因不同转录本之间在外显子-结构域上的变化。

蛋白相关数据库

在这个部分，总共发表了17个数据库 。其中有多个是和蛋白结构以及蛋白3D模型预测的数据库

其中InterEvDock3是一个用来分析两个蛋白之间对接的数据库。

流程化分析数据库

在这个部分，总共发表了5个数据库 。其中涉及到组学的各个方面，包括ATAC-seq以及质谱等等

其中LipiSuite是一个对脂质数据进行流程化的，数据前处理、差异分析、富集分析等分析的网站。

其他方面数据库

在这个部分，总共发表了9个数据库 。涉及了包括了文本挖掘，以及多组学分析各种工具。

其中Quickomics是一个可以对多组学数据进行分析的数据。可以分析RNA-seq，蛋白组学等数据。分析的内容也包括了常规分析的各个方面，比如差异分析、富集分析、聚类分析等等。同时也包括了各种分析可视化的图形。