使用sequenza软件判定肿瘤纯度
相关推荐
-
比对软件-Bowtie2
bowtie2 语法很重要!!!! Usage: bowtie2 [options]* -x <index> {-1 <m1> -2 <m2> | -U <r ...
-
PETCT和增强核磁哪个判定肿瘤占位更精准?
提示:本内容不能代替面诊,如有不适请及时线下就医 PETCT和增强核磁哪个判定肿瘤占位更精准? 问题描述:胰腺平滑肌肉瘤术后两年,北京协和医院增强核磁显示胰头有2.4cm的阴影,增强后实质与胰腺不一样 ...
-
使用ESTIMATE来对转录组表达数据根据stromal和immune细胞比例估算肿瘤纯度
文章发表于 (2013). "Inferring tumour purity and stromal and immune cell admixture from expression da ...
-
使用PyClone来推断肿瘤纯度及肿瘤内部亚克隆结构
首先要了解什么是肿瘤异质性:http://cnvkit.readthedocs.io/en/latest/heterogeneity.html 肿瘤异质性可分为肿瘤间异质性和肿瘤内异质性,其中肿瘤内异 ...
-
100篇泛癌研究文献解读之ESTIMATE算法计算肿瘤纯度
为了分析不同类型.组织起源肿瘤的共性.差异以及新课题.TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹,加州举行的会议中发起了泛癌计划.参考:https://www.ncbi.nlm.nih.gov ...
-
基于Seurat结果推断单细胞群肿瘤纯度之ESTIMATE
Inferring tumour purity and stromal and immune cell admixture from expression data.,NC,3013 单细胞转录组是揭 ...
-
(3条消息) VAF,MAF,肿瘤纯度,MCF,CCF的概念和计算方法 (转载)
VAF的概念和计算方法 VAF的全称是Variant Allele Frequency(变异等位基因频率)或Variant Allele Fraction(变异等位基因分数).简单来说就是在基因组某个 ...
-
腾讯医典:家属如何判定肿瘤患者濒临死亡?
肿瘤患者濒临死亡时,常常会出现一些症状和体征,而这些表现可以帮助家属判断患者死亡将近.但需要指出的是,并不是每个患者都会出现这些体征或症状,而且即使出现了一些类似的表现,也并不代表患者一定即将死亡.因 ...
-
智能纳米探针监视肿瘤淋巴转移实现高灵敏、高特异性检测和判定
原标题:智能纳米探针监视肿瘤淋巴转移实现高灵敏.高特异性检测和判定 (记者付东红 通讯员宋书香)近日,学术期刊<德国应用化学>在线发表了北京大学天然药物及仿生药物国家重点实验室汪贻广研究员 ...
-
MATH值量化肿瘤异质性受软件干扰太大而且临床意义不明显
前面我们看的文章都是说肿瘤异质性显著影响病人生存,而且MATH值很可靠,今天分享的发表在 Sci Rep. 2018 Jul 的文章就是来啪啪啪打脸的. MATH值代表的肿瘤异质性在乳腺癌与生存关系不 ...
