RNAseq数据，下载GEO中的FPKM文件后该怎么下游分析 / 开普饭

论文题目: Integrated bioinformatics analysis reveals key candidate genes and pathways in breast cancer 论 ...

很多时候我们得到的转录组格式为Count,例如在TCGA数据库下载的数据,如果我们想使用FPKM格式或者TPM,那么就需要转换,不过TCGA数据库也提供了FPKM的格式,貌似miRNA数据只有Coun ...

先看看MSigDB中的基因ENTREZID是否可以全部转化为SYMBOL. library(biomaRt)library(clusterProfiler)library(org.Hs.eg.db)l ...

单细胞转录组教程我们写的差不多了,是时候进军单细胞ATAC和空间单细胞了,找到了这个经典的 <单细胞ATAC>数据集:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/qu ...

一.文件夹检索法 1.把压缩文件解压到当前文件夹中图片发自简书App 2.找到文件夹右上角"搜索"处图片发自简书App 3.在"搜索"处输入关键词,如当事人 ...

学完了生信技能树的转录组课程,是时候实战一波了,我选择的是 NCBI数据集是SRP033333 Description KPC (Comparing mutant-p53 expressing cel ...

在GEO公共数据检索的时候,发现有一个数据集想要分析,但是发现是二代测序的数据,没有相关的原始数据处理经验,要怎么办呢? 二代测序对于没有生信基础的人的难点之前我们在介绍GEO分析基础的时候,提到过 ...

GEO数据下载真的好难吗?有些学员说真的好难呀,我下载了一个星期都下载不了,老是断,每次没有下载完就断了.就下载个数据就用了一个星期?有没有搞错,别人一个星期连文章都搞定了,而你只能下载数据的过程中徘 ...

当用户使用Folx完成了任务下载后,该任务仍会保留在下载列表中,并标注"已结束"的标记.随着使用时间的增长,folx下载列表中会包含过多的"已结束"任务,用户需 ...

键词:Excel2016,数据透视表,工作表拆分,操作难度** 工作场景:话说昨天小菜学会独孤九剑前三式后,工作效率大大提升,教务处王处长看着这个小同志好像工作不累,扔过来一个各系部教学检查汇总表,要 ...

投标文件编制的各步骤,都有不同的要求,各步骤之间的承接要有合理的过渡,才能完成投标文件的整个编制.同时投标文件的编制讲究严密,往往一个小小的错误,就可能导致整个项目前功尽弃.投标中的偏离是什么意思?在 ...

大数据时代新的市场研究方法使"无干扰"真实还原消费过程成为可能,智能化的信息处理技术使低成本.大样本的定量调研成为现实,这将推动消费行为及消费心理研究达到一个新的高度,帮助快速消费 ...

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