转录组Count格式数据转化为FPKM/TPM格式
相关推荐
-
你凭啥写“该基因在人体中高表达”--谁给你的勇气,梁静茹吗?
你凭啥写“该基因在人体中高表达”--谁给你的勇气,梁静茹吗?
-
关键问题答疑:WGCNA的输入矩阵到底是什么格式
虽然我们全国巡讲课程并不讲解WGCAN内容,因为时间的确有限,短短的3天要传授给大家R语言,linux还有RNA-seq数据分析实战,希望给大家打造好的基础成为合格的生信工程师,但是我们公众号有数不胜 ...
-
转录组学习六(reads计数与标准化)
任务 学习了解各个reads计数,及标准化的原理,如RPKM/FPKM/TPM的统计学原理: 了解reads计数的各个软件,用入门的htseq-count软件对每个样本内生成关于表达量的文件: 用脚本 ...
-
RNAseq数据,下载GEO中的FPKM文件后该怎么下游分析
我们有很多学徒数据挖掘任务,已经完成的目录见:学徒数据挖掘专题半年目录汇总(生信菜鸟团周一见) 欢迎大家加入我们的学习团队,下面看FPKM文件后该怎么下游分析 文献标题是:Oncogenic lncR ...
-
Omics精进09|mRNA生信分析常规流程
本文介绍「mRNA生信分析流程」 ❞ mRNA生信分析速览 mRNA生信分析主要包含以下各部分. mRNA分析详细步骤 数据质控及过滤 FastQC数据质控 关注测序数据的碱基质量.GC比等,见上图红 ...
-
试图厘清热图相关的一些细节
森严森语:生活中很多时候我都习惯于不知所以而为之,其结果通常坏.原因在于经常的盲目自信和偶尔不愿承认自己的无知.上篇推文介绍了利用Origin绘制热图的方法,推文一经发出,我就察觉到这是极其草率的.原 ...
-
excel超长数据对比视频:条件格式数据有效位数应用vlookup对比数据
excel超长数据对比视频|excel条件格式应用视频|excel数据有效位数视频|vlookup对比数据视频 本视频教程由部落窝教育分享.
-
#excel教学 #excel技巧 #excel 数据透视表 刷新后格式会变
#excel教学 #excel技巧 #excel 数据透视表 刷新后格式会变
-
谷歌地球专业版加载国界省区界市州界县乡镇行政边界kmz格式数据
谷歌地球专业版加载国界省区界市州界县乡镇行政边界kmz格式数据
-
“X天X小时X分钟”格式数据分别转换为分钟、小时、秒的方法
Excel情报局 OFFICE爱好者大本营 用1%的Excel基础搞定99%的职场工作 做一个有价值感的Excel公众号 Excel是门手艺 玩转需要勇气 数万Excel爱好者聚集地 自我提升也是一种 ...
-
倾斜摄影三维模型输出OSGB格式数据和OBJ,FBX,STL
在倾斜摄影三维数据中,OSGB数据居多.航拍的影像经过建模软件处理产出之时,有很多成果的数据需要我们去选择输出,对于不同的项目需求,我们需要选择合适的输出数据格式.他们之间有什么区别?分别是应用在哪些 ...
-
汇总几十家单位的数据,在不改动格式的情况下,有没有快速、准确的办法?
与 30万 读者一起学Excel VIP学员的问题,就是将模板发给几十家单位填写,收集以后进行汇总. 模板是这样,E列是让每家单位填写,填写后对所有工作簿进行求和. 我比较懒,就模拟2-3家,不管多少 ...
-
Golang 语言中怎么解码 4 种常见JSON 格式数据?
Golang 语言中怎么解码 4 种常见JSON 格式数据?
-
生信编程直播第12题:json格式数据的格式化
json数据大家统一用我给的测试数据,自己在浏览器打开下载:http://biotrainee.com/jbrowse/JBrowse-1.12.1/sample_data/json/modencod ...
-
TPM格式搜索错了,好尴尬
网上的答案经常不靠谱 通常情况下我会使用 featureCounts 得到表达矩阵是 raw counts, 但总是有人需要我转换成各种形式,比如 RPKM, FPKM and TPM 概念见: ht ...