实用！便携且高效去除基因组序列和注释碎片 / 开普饭

GFF(gff)全称为:general feature format GTF(gtf)全称为:gene transfer format 前者用来注释基因组,后者用来注释基因. 异同点: GTF文件和G ...

[TOC] 写在前面这是对宏基因组提取扩增子序列16S分析的第二部分,这部分将核糖体RNA基因组装后进行分析.上一节我们使用了 bbmap提取了核糖体序列,但是单纯用于ASV的方法聚类是不行的,以为 ...

[软件介绍]IGV软件的安装和基本介绍 - 目录 1. IGV 下载与安装 2. Java 安装及环境变量设置 3. IGV 基本介绍 3.1 IGV 界面布局 3.2 IGV 结果界面 3.3 序列 ...

目录一.什么是参考基因组和基因组注释?二.参考基因组版本命名1.常用人参考基因组对应表2.常用小鼠参考基因组对应表三.下载1.NCBI2.Ensemble3.GENCODE4.UCSC5.iGenom ...

咱们<生信技能树>的B站有一个lncRNA数据分析实战,缺乏配套笔记,所以我们安排了100个lncRNA组装案例文献分享,以及这个流程会用到的100个软件的实战笔记教程! 下面是100个l ...

撰文:周晗中南大学审稿:刘永鑫中科院遗传发育所 (宏)基因组学是测序研究生物功能的新领域.如今测序技术一直在进步,成本也大幅下降,数据在大量增加,但数据分析是非常耗时的,并且(宏)基因组注释涉及 ...

下面是MeRIP-seq 图表复现笔记在上一期:m6A图文复现02-数据下载和质控中我们得到了cleandata,接下来是要比对到参考基因上进行比对过程的分析.一般来说,在比对之前,我们可以选择先 ...

多年来,环境中的甲醛浓度一直呈上升趋势,尤其是城市的室内环境中.甲醛是一种毒性较高的物质,在我国有毒化学品优先控制名单上,甲醛位居第二.甲醛已经被世界卫生组织确定为致癌和致畸形物质,是公认的变态反应源 ...

全部样本全部样本混合拼装 mkdir ./assemblyall/ megahit --continue --out-dir ./assemblyall/megahit/ -m 0.9 -t 6 - ...

对于经常做视频剪辑的朋友应该都知道,当我们从网上下载一些视频做素材的时候,有很多视频文件都是带有水印的,而这时我们所使用带有水印的视频剪辑的话,其水印会很大程度上影响视频整体的美观,让视频看起来很杂乱 ...

编译:浩洁,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 苏黎世联邦理工学院生物系统科学与工程系的Randall Platt教授于2019年11月11日在Nature发表题目为<CRISPR ...

推荐:江舜尧编译:罗睺编辑:马莉美国纽约西奈山伊坎医学院精神病学.神经科学.遗传学和基因组科学学系Joseph Buxbaum与美国哥伦比亚大学生物统计学系 Iuliana Ionita-Laz ...

编译:橙,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读随着代谢组学技术的发展,尤其是以人类肠道中的微生物群落代谢组学为代表,为人们了解疾病患者体内被破坏的功能和稳态,分析不同调节途径之间的 ...

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