WebMGA：超快的基因组序列聚类注释在线工具 / 开普饭

写在前面这两天有看到几个用户朋友在生信札记讨论群中讨论了基因结构图的绘制.看到其他用户一直推荐 GSDS,我便也没有作声,毕竟 GSDS 确实是很优秀的网页软件.而现实情况是,近期 GSDS 网站无 ...

编译:流年梦,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读全面.高质量的参考基因组对于人类肠道菌群的功能特性和分类学分配研究至关重要.该研究提供了统一的人类肠道微生物基因组(UHGG)数据 ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读宏转录组宏转录组测序是对某一特定时期.特定环境样品中的全部微生物的RNA进行高通量测序,直接获得该环境中所有微生物 ...

写在前面目前,有大量物种的基因组序列和注释信息公布.几乎所有科研人员都可以下载并使用这些数据,分析和验证自己的科研假设.常常,我们会遇到一些小问题,比如基因组序列文件中包含了大量无法锚定到染色体的片 ...

全部样本全部样本混合拼装 mkdir ./assemblyall/ megahit --continue --out-dir ./assemblyall/megahit/ -m 0.9 -t 6 - ...

写在前面我经常使用一个不起眼的功能,Fasta Stat.但从未写过相关推送.主要是其使用过于简单,只要把 Fasta 序列文件放进去,点击 Start 就可以了.早上起来,突然想起了这一功能,并增 ...

写在前面伴随着越来越多的全基因组序列公布,比较基因组分析已然常规生信数据分析技能.MCScan 是最为常用的软件之一.久前,TBtools 已经将该软件打包,同时开放了一键化流程.用户只需要输入四个 ...

写在前面比较基因组分析中,常常会使用基因点阵图来查看大体的基因组共线性情况.基于我个人的认知,点阵图可能有几个用处: 确定共线性区块有无和情况观测WGD,Segmental Duplication ...

宏基因组中短序列的注释是理解测序微生物群落潜在功能的重要步骤之一.单纯利用局部匹配的注释容易混淆那些蛋白同源性且局部序列非常相似的序列,进而不能真实准确反映复杂蛋白质家族中多变的结构和功能域. 今天我 ...

写在前面 "快速"!"不需要序列比对"!"准确"!"系统进化树" !!! This procedure is a use ...

有一点请务必注意:本文首发于2020年10月3日,公司逻辑和估值可能有很大变化,结论不再具有参考意义.内容仅供了解公司基本面和学习使用,不能盲目的用于投资指导,谢谢. 要说未来医药行业最好的赛道是什么 ...

12月31日中科院正式发布了<国际期刊预警名单(试行>,现在总计包括了65本期刊,其中Metals也被列入了预警名单,预警等级"低". 我们从http://retra ...

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