宏基因组测序中短序列的注释 / 开普饭

关于宏基因组测序: 直接对提取的全宏基因组DNA建立随机小片段文库,能够获取更多的序列信息.通过组装.ORFs预测与注释,通过各种大型公共数据库进行相应注释,高精度解析微生物群落结构与功能,包括特色的 ...

瑞士洛桑大学Kirsten M. Ellegaard 和Philipp Engel 于2019年1月25日在<Nature Communications>上发表题目为<Genomic ...

本文由流年梦编译,十九.江舜尧编辑. 原创微文,欢迎转发转载. 导读纤维素是植物生物质的主要成分,是一种由β-1,4糖苷键链接D-葡萄糖单体而成的线性多糖.面对日益加剧的能源危机,数量丰富且可再生的 ...

基因结构预测中同源注释策略,将mRNA.cDNA.蛋白.EST等序列比对到组装的基因组中,在文章中通常使用以下比对软件: tblastn gamp exonerate blat 根据我的实测,以上软件 ...

编译:小友,编辑:Emma.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在本篇文章中,我们研究了来自生物废水处理厂的油菜微生物种群中广泛的表型可塑性和生态位互补性,对原位样品进行元组学分析(元基因组学. ...

导读土壤是病毒遗传多样性的储存库,但由于土壤自身特性及技术手段的限制,基于传统培养方法对土壤病毒的研究及功能认知存在局限性.宏病毒组学技术能直接从土壤环境样品中获取病毒基因组,随后通过高通 ...

编译:独世,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读混合培养的生物技术过程的发展取决于对微生物生态系统如何响应干扰的理解.本文揭示了来自生物废水处理厂的含油微生物种群中广泛的表型可塑性 ...

写在前面 Mapman 是一款为植物通路分析专门设计的界面化软件,发表于2004年,其后不断更新,直到今日.我们也常常能在近期发表的一些文章中看到 Mapman 输出图稿的身影.在几年前,我写了系列 ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读宏转录组宏转录组测序是对某一特定时期.特定环境样品中的全部微生物的RNA进行高通量测序,直接获得该环境中所有微生物 ...

本文由卡内斯坦编译,董小橙.江舜尧编辑. 原创微文,欢迎转发转载. 导读微生物组学研究主要涉及两方面技术:测序技术和数据分析技术.近年来,这两方面技术都在不断进步.如何为自己的研究选择恰当的技术方法 ...

编译:独世,编辑:木木夕.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读微生物在硫的生物地球化学循环中起着重要作用,硫是地球生物圈中的重要元素.鸟枪法宏基因组测序为我们进一步了解参与硫循环的微生物群落开辟 ...

宏基因组测序中短序列的注释