【直播】我的基因组70：比对文件并不能完美的还原出测序文件 / 开普饭

bwa使用Burrows–Wheeler Transform (BWT)算法,利用backward搜索,针对不同reads长度,有三种算法「BWA-backtrack」, 「BWA-SW」和「B ...

NGS数据分析实践:06. 数据预处理 - 序列比对+PCR重复标记+Indel区域重比对+碱基质量重校正目录 1. 序列比对 1.1 参考基因组建索引 1.2 序列比对 2. 排序 3. PCR重 ...

昨天,我们了解了一下SAM格式的比对结果,不知道大家理解的怎么样.但是全基因组测序数据实在是太大了,即使比对后把sam文件压缩成二进制的bam文件也还有55G(如何压缩转换可查看直播十二),如果完整的 ...

前面我们说到了那些简单的由单个基因决定的性状,这东西不需要预测,其中的生物学机制已经研究的非常透彻,只要拿到你的基因信息,很容易推断你的性状,比如人的乙醇脱氢酶和乙醛脱氢酶等多种乙醇代谢基因,你本身是 ...

问题描述这个需求很常见,因为一般生物信息学数据比较大,比如sam,vcf,或者gtf,bed都是把所有染色体综合在一起的文件.如果想根据染色体把大文件拆分成小的文件呢?比如:ftp://ftp.ncb ...

最近的全国巡讲不少人问到我两年前的直播基因组系列教程的完整目录,这里先放出直播我的基因组(第一阶段)完整目录.(悄悄告诉你,后台回复直播可以拿到精排版EXCEL表格!)(然后,点击阅读原文也可以拿到可 ...

在古代时候,都是皇帝说了算,要知道皇帝有生死大权,君让臣死,臣不得不死,而且有很多冤案发生,有时候皇帝明明知道这是错的,但是金口玉言还会将错就错,死不瞑目的人很多! 明朝是朱元璋打下来的江山,这里面吃 ...

原创范吉完美Excel 2018-10-11 经常有人需要从关闭的工作簿文件中取值,省掉打开工作簿的操作.而此处介绍的技巧,所涉及到的工作簿文件都不需要打开,就可以完成将某工作簿文件中的数据迁移到 ...

【直播】我的基因组70：比对文件并不能完美的还原出测序文件