宏基因组学入门四部曲之初识
相关推荐
-
科研 | 微生物学研究,用多组学就够了吗?
需要本文原文可以联系江舜尧,文末有联系方式. 原文题目:Are multi-omics enough? 期刊:Nature Microbiology IF:N/A 发表时间:2016年7月26日 通讯 ...
-
技术贴 | 宏转录组专题 | 盘点宏转录组分析方法
本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 宏转录组 宏转录组测序是对某一特定时期.特定环境样品中的全部微生物的RNA进行高通量测序,直接获得该环境中所有微生物 ...
-
综述 | Nature子刊:微生物组学研究方法,看这一篇就够了(IF:31.851)
本文由卡内斯坦编译,董小橙.江舜尧编辑. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 微生物组学研究主要涉及两方面技术:测序技术和数据分析技术.近年来,这两方面技术都在不断进步.如何为自己的研究选择恰当的技术方法 ...
-
科研 | SBB:基于扩增子、宏基因组序列预测微生物群落代谢特征
编译:橙,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 随着代谢组学技术的发展,尤其是以人类肠道中的微生物群落代谢组学为代表,为人们了解疾病患者体内被破坏的功能和稳态,分析不同调节途径之间的 ...
-
易基因 | 宏基因组测序带给了我们什么?
关于宏基因组测序: 直接对提取的全宏基因组DNA建立随机小片段文库,能够获取更多的序列信息.通过组装.ORFs预测与注释,通过各种大型公共数据库进行相应注释,高精度解析微生物群落结构与功能,包括特色的 ...
-
技术贴 | 微生太宏基因组报告解读(开篇)
本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 宏基因组由来: 微生物世界是分子多样性最大的天然资源库,基于菌株水平的传统分离培养技术为人们认识微生物多样性提供了可 ...
-
宏基因组学入门四部曲之《Assembling the microbial dark matter》阅读笔记
写在前面 <Assembling the microbial dark matter>是比勒费尔德大学一位博士的毕业论文,该博士论文主要利用单细胞测序技术.宏基因组和宏转录组学技术来研究b ...
-
宏基因组学入门四部曲之向前一步
紧接着上个星期学习初步认识了宏基因组学的基本概念.了解的宏基因组数据分析方面的软件.我继续深入学习,这里是学习TGAC宏基因组教程的学习笔记. 内容 组学项目研究成本 随着测序技术的发展,测序成本会逐 ...
-
A轮总融资7500万美元,Metagenomi基于宏基因组学,构建出效率高达95%的基因编辑系统
近日,基因编辑公司Metagenomi宣布完成A+轮融资,将A轮融资总额从2020年11月的6500万美元提升至7500万美元.Metagenomi表示此次融资资金将用于公司团队的扩张和治疗管线产品的 ...
-
Nature 子刊:三代测序的DNA提取和宏基因组学分析
改进的人类肠道微生物组的高分子量DNA提取,纳米孔测序和宏基因组学装配 Improved high-molecular-weight DNA extraction, nanopore sequenci ...
-
宏程序入门基础知识
文件格式 1.程序第一行需使用'%'宣告为标题行,并加入关键词'@MACRO',否则将按ISO格式文档处理,从而导致部分功能无法使用. 2.每一行结束需加分号':'. 变量 宏程序使用的变量可分为三 ...
-
科研|Chemical Society Reviews:结合代谢组学和宏基因组学来示踪代谢多样性
编译:太阳味的风,编辑:Emma.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 微生物和植物的特殊代谢物具有庞大的化学多样性,这些代谢物在调节物种间互作过程中发挥关键作用.同时,它们也被认为是天然产品,被 ...
-
科研| Cancers:结直肠癌粪便宏基因组学与代谢组学的综合分析
编译:阿温,编辑:谢衣.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 虽然结直肠癌(CRC)是发达国家的第二大死亡原因,但目前对疾病早期阶段的诊断测试并不理想.我们对224个粪便样本进行了UHPLC-MS ...
-
科研 | SBB:(国人佳作)DNA-SIP和宏基因组学相结合揭示锑污染水稻土中存在硝酸盐依赖性的锑矿氧化细菌
编译:微科盟达达兔,编辑:微科盟木木夕.江舜尧. 微科盟原创微文,欢迎转发转载. 导读 锑矿(Sb(III))氧化(SbO)可以降低锑(Sb)的毒性以及锑(Sb)在水稻中的积累,从而在稻田Sb污染的生 ...
-
Cell子刊 | 肠道噬菌体-细菌关联的宏基因组学数据有助于抗致病共栖菌谱的噬菌体疗法的发展
推荐:江舜尧 编译:小鹿同学 编辑:小菌菌 日本东京大学医科学研究所人类基因组中心健康医学情报系Seiya Imoto教授和大阪市立大学医学院研究生院免疫学与基因组学Satoshi Uematsu教授 ...