CircRNA测序 | 百迈客生物

circRNA建库与其他RNA相比,有何不同?

对于circRNA,有2种建库方式,一种是去线性化,这种方式只可以得到circRNA的信息,因此,如果只集中研究circRNA,可以选择此种方式;另外一种是非去线性化,通过这种方式建库,可以同时获取mRNA、lncRNA和circRNA的信息。因此,关注更多RNA以及研究RNA相互关系,可以选择此种方式。

芯片circRNA研究与二代测序技术有什么区别?

由于目前对circRNA的研究相对较少,注释并不全面,由于芯片只能检测已知环状,因此会缺失许多新的circRNA信息以及大量特异表达的circRNA。二代测序技术通过软件进行环状RNA鉴定,既可以鉴定已知环状RNA,也可以预测新的环状RNA。因此,对于环状RNA研究而言,二代测序获取信息更全面。

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