热图怎么做？ | 热图函数pheatmap() | | 百迈客生物基因 / 开普饭

前面我们推送了南方医的一个后起之秀的新R包:快来使用ggheatmap强化你的热图吧!已经正式被R语言社区的CRAN接受了,大家可以放心的使用起来!而且作者还给出来了一个实例:ggheatmap复现C ...

[Pheatmap 绘制多分组热图] 热图作为实验数据分布情况的直观展示方法,已经成为高分文章的不错选择,它不仅可以对数据质量进行具像化展示,还可以对数据和样品进行聚类.在R中有多个包均可绘制热图,今 ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=23891 可以使用环状图形展示基因数据比较.可以添加多种图展信息,如热图.散点图等. 本文目标: 可视化基因组数据制作环形热图环形热图很漂亮.可 ...

# 6. 可视化展示 ---------------------------------------------------------------- ##6.1 火山图 library(ggplot ...

前两天我向大家推了16s做差异分析的两个包(没有看的请点击下面链接): 1.16s分析之差异分析(DESeq2) 2.16s分析之差异OTU 挑选(edgeR) 差异做出来了如何展示,也是一个值得思考 ...

pheatmap是一个非常受欢迎的绘制热图的R包.ComplexHeatmap包即是受之启发而来.你可以发现Heatmap()函数中很多参数都与pheatmap()相同.在pheatmap的时代(请允 ...

前面的单细胞RNA-seq揭示TNBC的异质性(图表复现03)教程里面我们一起复现了文章" Unravelling subclonal heterogeneity and aggressiv ...

咱公众号也不能只做一个系列,所以经过深思熟虑,打算将来慢慢增加一些内容,主要有以下几个系列TCGA数据分析系列GEO数据分析系列"老板给一个基因,我该怎么办"系列文献阅读系列R语言 ...

导读: pheatmap默认会对输入矩阵数据的行和列同时进行聚类,但是也可以通过布尔型参数cluster_rows和cluster_cols设置是否对行或列进行聚类,具体看分析需求.利用display ...

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