CIBERSORT肿瘤免疫微环境分析，一文就搞定

相关推荐

• 6分+ 免疫检查点抑制剂疗效预测的纯生信分析

  大家好,今天要和大家分享的是2021年4月发表的一篇文章:"Systematic Assessment ofTranscriptomic Biomarkers for Immune Chec ...

• 纯生信10分 ，m6A甲基化修饰与肿瘤微环境

  m 6 A regulator-mediated methylation modification patterns and tumor microenvironment infiltration c ...

• 15+分的纯生信：胃癌m6A​和肿瘤免疫微环境

  虽然MC目前2018年的IF是10.679,但是我们之所以说是15+分呢,是因为MC在6月就要公布在2019年的影响因子是15.96分,说不定还能在这段时间努努力,突破到16分! (图片来源:桑格助手 ...

• 免疫浸润算法那么多，要怎么选呢？

  对于基于转录组数据来评价样本当中的免疫细胞浸润情况的算法已经开发出了很多种了.之前我们在介绍TIMER2.0以及这两个免疫浸润数据库的时候,也提到了很多中算法.例如GEPIA2021就是基于CIBER ...

• 华西师兄带你详解机器学习结合生信数据库挖掘发表的Ebiomedicine(IF=6+)文献

  作者介绍 :本文作者大可,四川大学华西医院肿瘤中心科研搬砖工,研究兴趣包括机器学习在高维组学问题中的应用,预测模型的开发与验证.已发表多篇生信和机器学习相关sci文章. 编辑校稿:白介素2 各位朋友大 ...

• 这篇3+分文章带你学会多数据库分析免疫浸润

  The immune infiltration in clear cell Renal Cell Carcinoma and their clinical implications: A study ...

• 文献详解丨听说这个国自然热点随随便便就能发篇6+文章

  小编听到说别人在一个月内利用"热点"发表了3篇5+的文章,比如铁死亡,免疫浸润,丝切蛋白等等.那么热点要搭配哪些分析流程才能发高分?今天,就围绕近期热点--铁死亡,给大家整理一个热 ...

• 直击热点，巧用ssGSEA进行免疫浸润分析

  关于免疫浸润分析,可谓是最近一段时间的热点,很多文章基于肿瘤免疫细胞微环境进行分析,不管是进行下游基因筛选也好,还是构建诊断模型也好,发表了很多相关的研究.在前面关于<CIBERSORT在免疫浸 ...

• 肿瘤微环境看基质和免疫细胞就太泛了

  我们在前面使用3个教程来说明肿瘤微环境,,是一个目前比较流行的方法 estimate看基质和免疫细胞比例 ,来源于2013数据挖掘文章,作者就整理了两个基因集来根据表达量矩阵使用estimate方法去 ...

• 3.9分 非肿瘤生信+实验验证 经典蹭热点思路 不到2个月接收

  在本项研究中,作者利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)阐明与脊髓损伤(SCI)相关的特定模块和中枢基因.首先,作者从GEO数据库下载基因表达谱GSE45006和GSE2599,通过WGCNA分析识 ...

• 定量免疫浸润在单细胞研究中的应用

  男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树, 一枚大型测序工厂的螺丝钉, 一个随机森林中提灯觅食的津门旅客. 最近听说定量免疫浸润很火,于是我也报名参加了果子老 ...

• 肿瘤中调节性T细胞浸润的机制

  前言 随着免疫检查点抑制剂等癌症免疫疗法在多种癌症类型中的广泛应用,肿瘤微环境(TME)中的免疫景观对于确定最佳癌症治疗变得极其重要.根据免疫细胞浸润程度及其激活状态,肿瘤在免疫学上可分为两类:炎症性 ...

• 7+免疫治疗ICI评分，火爆预定中

  导语 今天和大家分享的是2020年8月份发表在Mol Ther Nucleic Acids杂志上的一篇文章(IF=7.032)"Characterization of the Immune ...