蛋白质互作关系（PPI）数据库你还在使用string吗 / 开普饭

蛋白质组学的概念最先由MarcWilkins于1994年首次提出,是以一种基因组所表达的全套蛋白质为研究对象,即通过大规模.高通量.系统性地研究细胞.组织或生物体的蛋白质特征(包括蛋白质的表达水平,翻 ...

写在前面关于探究的蛋白质相互作用的数据库,之前介绍过STRING就是这样的数据库,为什么很多生信的文章都是使用STRING来探讨基因之间的相互作用关系,主要原因还是STRING支持输入多个基因,寻找 ...

蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)是指两个或两个以上的蛋白质分子通过非共价键形成蛋白质复合体(protein complex)的过程. 在生物 ...

来源:<中国科学报>2021-10-13 09:31 X 日前绘制的首张癌症蛋白质相互作用图谱涵盖了以前被忽视的突变,而这些突变可能成为治疗的目标. 美国加州大学圣地亚哥分校的Trey I ...

目前,cBioPorta.GEPIA等现有生物学工具为基因表达分析提供了许多有用的可视化和分析工具,但是并不能充分解决实验生物学家要求的其他一些快速分析.例如,根据初步结果选择特定的细胞系进行进一步研 ...

翻译:周之超@UW-Madison 基因组水平解析的宏基因组学揭示了地下水生态系统中附生性CPR细菌和DPANN古菌的位点特异性多样性 Genome-resolved metagenomics rev ...

供稿人:汪雨清整理编辑:谢许茵 1 前言人的皮肤和粘膜上有大量微生物定居,包括细菌､真菌､病毒等,其中大部分是细菌[1]｡肠道菌群作为人体微生物的主要成员,被称为人体的一种"器官&quo ...

撰文:存在一棵树 IF=38.637 推荐度:⭐⭐⭐⭐⭐ 亮点: 通过15650次免疫沉淀构建了两个蛋白质组规模的细胞系特异性相互作用网络,该网络对相互作用组进行建模,通过相互作用组的结构编码蛋白质功 ...

之前小编为大家推送了利用DAVID网站进行差异基因的GO和KEGG分析,而基因功能注释后就可以寻找蛋白表达之间的关系了,在生信分析中,常常会使用STRING网站+Cytoscape软件来制作蛋白互作网 ...

这个网站作图有多好? 官网图例分析报告模仿科研论文的格式来展现分析结果,图文并茂,对生物学者极其友好: 报告中详细阐述了分析方法和图形的意义,而且图形都含可以发表的高清晰文件格式: 报告还提供了格式 ...

这是<肠道产业>第 728 篇文章编者按植物与真菌之间存在复杂的相互作用.在大多情况下,植物为真菌提供碳,真菌为提供无机盐,达到互利共生的目的,而在某些情况下,真菌却成为导致植物病害的 ...

ChIP-Seq相信很多老师已经很熟悉了,然而在做ChIP-Seq实验时,甲醛交联的效果,抗体的选择,超声的效果等因素都很大地影响了实验的成功率,您是否也在为此苦恼呢?下面派森诺生物就带大家了解一下C ...

那天突然在NCBI上发现了一个蛋白质互作.分子对接的工具 --还蛮有意思,这个工具就叫宜必思-- 输入PDB ID后,就可以查询了, 这里就随便输了一个蛋白的PDB ID-- 点击上面的Network ...

蛋白质互作关系（PPI）数据库你还在使用string吗