Metascape：基因注释、功能富集分析、蛋白质互作分析 / 开普饭

前几天和大家介绍了一下GEO数据库以及使用GEO2R进行差异表达分析GEO2R差异表达分析软件.几乎现在的套路性文章在做完差异表达分析后,都会去做GO和KEGG富集分析.那么GO和KEGG都是什么?富 ...

编译:YQ,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读杂种优势指杂交的F1代在抗病性.产量质量等性状上优于纯合亲本的生物学现象,广泛应用于作物和动物的选育上,然而其分子机制尚未研究清楚. ...

Identification of significant gene biomarkers of low back pain caused by changes in the osmotic pres ...

功能富集分析你还在使用clusterProfiler R包进行编程绘图吗?今天要和大家介绍一款强大的基因功能富集分析的在线工具--Metascape,由诺华研究基金会基因组研究所(GNF)的一组研究人 ...

通过组学测序得到一组基因或蛋白后,对着测序报告中给的热图火山图,很多新手都是很困惑的.对于这些结果,我们还能做些什么,才能对我们的后续研究工作提供真实可靠的提示与帮助呢?能否得知这些基因主要参与了哪些 ...

那天突然在NCBI上发现了一个蛋白质互作.分子对接的工具 --还蛮有意思,这个工具就叫宜必思-- 输入PDB ID后,就可以查询了, 这里就随便输了一个蛋白的PDB ID-- 点击上面的Network ...

撰文:存在一棵树 IF=38.637 推荐度:⭐⭐⭐⭐⭐ 亮点: 通过15650次免疫沉淀构建了两个蛋白质组规模的细胞系特异性相互作用网络,该网络对相互作用组进行建模,通过相互作用组的结构编码蛋白质功 ...

蛋白质互作网络(Protein-Protein Interaction Networks,PPI) 是由蛋白通过彼此之间的相互作用构成,来参与生物信号传递.基因表达调节.能量和物质代谢及细胞周期调控等 ...

先吐槽一下自己:从公众号申请到现在,两年发了5个动态.立个Flag,2020年接下来发10个动态 . PPI互作分析用到的工具: STRING数据库+Cytoscape软件 1.STRING数据库 S ...

今天给大家介绍一个工具FunRich,FunRich (Functional Enrichment analysis tool) 是一个主要用于基因和蛋白质的功能富集和相互作用网络分析的独立的软件工具 ...

新课发布在B站了,马上有热心的粉丝看完后写了配套笔记: 下面是粉丝linbo的笔记投稿多个亚群各自merker基因联合进行GO以及KEGG分析在前面几节我们已经知道各个细胞亚群的maerker基因 ...

TCGA转录组数据在完成差异分析后,我们通常希望系统地获取这些成百上千的差异基因的功能信息,帮助我们分析下游实验的思路.面对大量的差异基因,逐个查询基因功能是不切实际的.所以我们需要借助基因功能富集分 ...

近日,国际知名期刊<核酸研究>(Nucleic Acids Research,IF:16.971)在线发表了北京大学孔雷课题组与中国科学院计算技术研究所赵屹研究员课题组合作开发的基因功能富 ...

Metascape：基因注释、功能富集分析、蛋白质互作分析