蛋白组学数据处理之PPI互作分析 / 开普饭

昨天我们介绍了一些网络分析当中用到的一些基础的知识(相互作用网络分析基础).对于基因组数据分析而言的话,我们能用到网络分析的就是蛋白相互作用分析(protein-protein ineraction, ...

利用一周多的时间,我们把最最基本的生信套路来讲解了一遍.正好前几天一个小伙伴拿了一篇相关文献在咨询问题.这里就拿这篇文献来总结一下我们目前写的这些东西. 这次我们来讲解的这边文献是2019-10-12 ...

期刊:<Genes> 影响因子:4.096 文章题目:Tandem Mass Tag-Based Quantitative Proteomic Analysis of ISG15 Knoc ...

蛋白质互作网络(Protein-Protein Interaction Networks,PPI) 是由蛋白通过彼此之间的相互作用构成,来参与生物信号传递.基因表达调节.能量和物质代谢及细胞周期调控等 ...

如果有几十个基因或是蛋白,我想制作一个它们间的互作网络图,是不是特别难?我们这种菜鸟级别的,是不是做不了.答案是否定的,现在主流使用R语言来做,但也有很多在线网站可以完成简单这样的分析,今天就给大家介 ...

在 6月期间 ,总共发表了医学相关在线数据库53 个.下面就来给大家介绍一下主要有哪些数据库,以及笔者比较感兴趣的数据库.如果想要所有相关数据库信息的,后台回复:2106 . 疾病和药物相关数据库在 ...

昨天我们介绍了ConsensusPathDB的基本功能以及其在蛋白相互作用查找当中的使用.今天我们继续把ConsensusPathDB剩下的功能来进行介绍.2. 基因富集分析2.1 数据库输入对于这类 ...

编译:苑志宇,编辑:Tracy.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读细胞热位移测定法(CETSA)是最近出现的一种有发展前景的技术,可以直接监测完整细胞和组织样品中蛋白互作状态及其功能调节.最近 ...

编译:阿温,编辑:Tracy.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 GPR52是一种A类孤儿G蛋白偶联受体(GPCR),被认为是治疗亨廷顿病和多种精神疾病的理想靶点.尽管最近有研究发现GPR52的 ...

编译:阿温,编辑:Tracy.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读应激颗粒(SGs)是蛋白质和非翻译mRNA的细胞质组装体.虽然人们对SG地层已有许多了解,但对SGs在正常拆卸和疾病条件下发生的 ...

编译:小友,编辑:Emma.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在本篇文章中,我们定量分析了7000多种细胞蛋白和71种病毒蛋白,并提供了裂解性KSHV感染过程中蛋白变化的时间概况.裂解性KSH ...

编译:小北,编辑:Emma.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 2型糖尿病(T2D)在世界范围持续增加,包括心血管疾病在内的并发症也随之升高,研究代谢组学紊乱与糖尿病发病机制之间的关系是非常必要 ...

编译:小北,编辑:Emma.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在本期的<Cancer Cell>杂志上,Pillarsetty及其同事对潜在的抗癌药物PU-H71进行放射标记,结合 ...

编译:伊安,编辑:小白.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读肉瘤是一组具有70多个组织学亚型的间充质恶性肿瘤.目前大多数肉瘤发生发展的分子机制尚未明确,这阻碍了肉瘤的临床治疗和预后发展.迄今为止 ...

编译:伊安,编辑:小白.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读肉瘤是一组具有70多个组织学亚型的间充质恶性肿瘤.目前大多数肉瘤发生发展的分子机制尚未明确,这阻碍了肉瘤的临床治疗和预后发展.迄今为止 ...

蛋白组学数据处理之PPI互作分析