一篇最基本生信分析文献解读
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miRNA‑mRNA调控网络发文思路
参考文章题目:Identification of biomarkers and construction of a microRNA‑mRNA regulatory network for clear ...
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哈?确定这是我零代码能复现的非肿瘤文章吗!
解螺旋公众号·陪伴你科研的第2541天 零代码复现非肿瘤文章 大家好,我是濤濤.众所周知,仙桃生信工具www.xiantao.love一直致力于协助大家在进行生信研究提供便利性.最近,仙桃生信工具又推 ...
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5.2分SCI 单基因生信+组化验证
本研究作者旨在探讨钙结合蛋白家族成员S100A16在胰腺癌(pancreatic cancer , PC)中的表达和预后价值评估.首先利用Oncomine检测S100A16在PC等肿瘤中的表达水平及预 ...
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GEO数据纯生信准3分SCI思路
研究背景: 卵巢癌在全球与妇科癌症相关的死亡中排名第五.到目前为止,尚未完全了解卵巢癌的肿瘤发生和预后的分子机制.这项研究旨在发现参与卵巢癌的hub基因和治疗药物. 研究方法: 从Gene Expre ...
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GEO+TCGA数据挖掘+收集临床样本的思路
研究背景: 肺腺癌(LAD)是最普遍的肺癌类型.据报道,UDP-N-乙酰氨基葡糖焦磷酸化酶1(UAP1)的异常表达与癌细胞的许多生物学过程有关,但尚不清楚LAD中UAP1的表达. 研究方法: 生物信息 ...
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纯生信3+肾癌免疫微环境预后相关基因
悄悄告诉大家,2019年J Cell Biochem的影响因子预计会超过4分! Identification of microenvironment‐related genes with progno ...
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GEO联合TCGA数据挖掘文献分享
今天要介绍的这篇章是我们中国人写的,发表在Med Sci Monit上,这篇文章主要是通过下载GEO和TCGA的数据,通过差异表达分析,GO富集分析.KEGG富集分析,PPI分析,COX回归分析,筛选 ...
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做生信数据挖掘一定要会编程吗
自从meta分析贬值了之后,生信数据挖掘成为了国内医生.研究生.博士.教师火爆的发文神器,可是令人头痛的事情来了,生信往往需要学习编程,其中R就必不可少,如果要挖TCGA.SEER,Perl或者Pyt ...
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高分生信+实验文献解读
目前的很多文章都是以组学分析开头+后续实验来进行构架的,其中组学分析的话,又以聚类相对来说不叫新一些,所以这次就给大家抄读一个类似的文章吧.这次抄读的文章是发表在19年发表在Elife的一篇文章. 基 ...
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文献详解丨生信分析 细胞二代测序,轻松6分 ,这样的套路不来一个?
本文研究的是传统中药复方桂枝茯苓丸治疗乳腺癌的机制,分为3个部分:第一部分,利用网络药理学方法筛选桂枝茯苓丸的有效成分和治疗乳腺癌的潜在靶标,公共数据验证:第二部分,基于高通量测序的高通量筛选技术靶向 ...
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[2019文献阅读收官]胃癌免疫微环境-生信分析典范
欢迎来到医科研,这里是白介素2的读书笔记,跟我一起聊临床与科研的故事, 生物医学数据挖掘,R语言,TCGA.GEO, SEER数据挖掘. 2019年的最后一天了,跟大家一起读一读文献吧,基于公共数据库 ...
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自噬只能做实验?这篇4+分文章教你做热门通路生信分析!
Prognostic implications of autophagy-associated gene signatures in non-small cell lung cancer 自噬相关基因 ...
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非肿瘤研究领域生信分析思路以及经典文献推荐
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SCI科研写作:仅利用数据库如何做好单基因免疫浸润生信分析
怎样才能不做实验,不用R语言,还能发3分+SCI? 今天介绍几个可以用得上的数据库,只利用数据库中的数据进行分析,甚至不用R,利用在线分析工具,敲敲电脑就能解决急需发文章,没时间做实验,没有科研经费的 ...
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平平无奇,8个数据库凑一篇5+纯生信?别犹豫了,赶紧上车!
解螺旋公众号·陪伴你科研的第2562天 零代码复现基因家族分析 今天我为大家带来一篇发表在Frontiers in Oncology杂志上,影响因子为4.848的一篇分析基因家族的生信文章,之前我复现 ...
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精心整理(含图PLUS版)|R语言生信分析,可视化
为了能更方便的查看,检索,对文章进行了精心的整理(PLUS).建议收藏,各取所需,当前没用也许以后就用到了呢! R资料+计划 R语言精品资料年中无套路赠送 R-plotly|交互式甘特图(Gantt ...
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生信分析零基础——从GEO到TCGA,让你从「门外汉」到「老司机」
什么是生信?提起生信,相信大家又爱又恨,得不到的永远在骚动.爱是不用做实验就能发原创研究,好棒啊.恨是看不懂那一大串代码,不会操作. 目前,不做实验发文章的主要有两大类:Meta分析,生信.其中生信文 ...