PPI分子网络构建，你一定要学会的string数据库 / 开普饭

利用一周多的时间,我们把最最基本的生信套路来讲解了一遍.正好前几天一个小伙伴拿了一篇相关文献在咨询问题.这里就拿这篇文献来总结一下我们目前写的这些东西. 这次我们来讲解的这边文献是2019-10-12 ...

昨天我们介绍了一些网络分析当中用到的一些基础的知识(相互作用网络分析基础).对于基因组数据分析而言的话,我们能用到网络分析的就是蛋白相互作用分析(protein-protein ineraction, ...

就应该会纳闷,为什么拿到了差异基因并且注释后就结束了,明明大量的数据挖掘文章都有一个网络图并且找hub基因啊! 主要是因为,这个步骤呢,主要并不是R代码完成,是需要把差异基因列表输入到string这个 ...

●STRING数据库介绍 ● 做科研的时候,为了研究蛋白之间的相互作用网络,我们需要借助一些蛋白质相互作用数据库,而string(Search Tool for the Retrieval of In ...

Identifification of Candidate Genes and Therapeutic Agents for Light Chain Amyloidosis Based on Bioi ...

先吐槽一下自己:从公众号申请到现在,两年发了5个动态.立个Flag,2020年接下来发10个动态 . PPI互作分析用到的工具: STRING数据库+Cytoscape软件 1.STRING数据库 S ...

昨天我们介绍了ConsensusPathDB的基本功能以及其在蛋白相互作用查找当中的使用.今天我们继续把ConsensusPathDB剩下的功能来进行介绍.2. 基因富集分析2.1 数据库输入对于这类 ...

编译:夕夕,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读水稻(Oryza sativa L.)是一种主要的农作物,是大约50%的人口热量的主要来源,它对温度胁迫表现出各种生理反应,这些响应通 ...

编译:姜意达,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读老鼠大脑里大约包含7500万个神经元且互相连接在大量的神经回路(neuron circuits)中,但是有相当一部分的单个神经元的组 ...

编译:文文,编辑:Emma.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读蛋白质组学技术及其它组学技术的飞速发展,为临床疾病的机制研究和诊断标志物的发现提供了前所未有的机遇,高通量蛋白质测序可以在临床生物 ...

今日份搞笑段子 01 #如何辨别网络帅哥# via:@cpdd 学会了 02 #不同工资对待老板的区别# via:@关爱打工人月薪1k:领导夹菜我转桌,领导喝水我刹车,领导说话我放歌 03 #如何轻 ...

22:59[3ds max 科研绘图] 流程图实例-渲染 3813 2020-5-7 07:40[3ds max 科研绘图]流程图 -核壳-分子网络- 负载粒子 593 2020-5-7 07:03[ ...

hello大家好,小月亮又和大家见面了.上篇软文小月亮给大家介绍了NetworkAnalyst3.0工具的概览.这次小月亮就给大家详细介绍NetworkAnalyst3.0工具如何对单.多个基因列表数 ...

摘要:本文针对中职网络构建课程教学现状,探索利用模拟软件进行网络构建课程教学改进,采用Packet Tracer这款界面直观.操作简便的软件模拟网络构建实验环境,克服传统教学依赖实训环境和硬件设备的 ...

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