NetworkAnalyst3.0：差异基因筛选，功能富集分析、基因网络构建等功能于一体的在线基因表达分析工具 / 开普饭

男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树, 一枚大型测序工厂的螺丝钉, 一个随机森林中提灯觅食的津门旅客. 面向单细胞的技术革命,让我们得以进入新的研究层面, ...

没有时间.没有经费做实验的穷苦科研人,利用这方法零成本的方法照样可以发3分的SCI.下面我们将这种方法分享给大家,这里介绍的文章题目如下:Integrative analyses of biomark ...

通过组学测序得到一组基因或蛋白后,对着测序报告中给的热图火山图,很多新手都是很困惑的.对于这些结果,我们还能做些什么,才能对我们的后续研究工作提供真实可靠的提示与帮助呢?能否得知这些基因主要参与了哪些 ...

废话不多说,我们直接上文章:Identification of Key Genes in Thyroid Cancer Microenvironment 文章摘要: Background: Tumor ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2555天 9分新冠相关生信文章复现今天为大家带来一篇影响因子8.99分的新冠相关的纯生信文章,影响因子虽高,但复现难度却不大,这让我深刻体会到雪球老师所说的," ...

今天要介绍的这篇章是我们中国人写的,发表在Med Sci Monit上,这篇文章主要是通过下载GEO和TCGA的数据,通过差异表达分析,GO富集分析.KEGG富集分析,PPI分析,COX回归分析,筛选 ...

图1:生物网络示例目录一.什么是生物网络? 二.生物网络的相关概念三.知名学者介绍四.相关资源推荐五.集智百科词条志愿者招募 1.什么是生物网络? 生物网络是对生物系统以图(graph)的方 ...

TCGA转录组数据在完成差异分析后,我们通常希望系统地获取这些成百上千的差异基因的功能信息,帮助我们分析下游实验的思路.面对大量的差异基因,逐个查询基因功能是不切实际的.所以我们需要借助基因功能富集分 ...

这个网站作图有多好? 官网图例分析报告模仿科研论文的格式来展现分析结果,图文并茂,对生物学者极其友好: 报告中详细阐述了分析方法和图形的意义,而且图形都含可以发表的高清晰文件格式: 报告还提供了格式 ...

近日,国际知名期刊<核酸研究>(Nucleic Acids Research,IF:16.971)在线发表了北京大学孔雷课题组与中国科学院计算技术研究所赵屹研究员课题组合作开发的基因功能富 ...

转录组.蛋白组等测序结束后,筛选差异基因之后需要做的第一步工作可能就是需要功能富集,看基因的作用.做富集的工具也有很多,在线的工具也有大批,但是总体来说更新较慢,可视化操作不是很强. R语言成了很多人 ...

富集分析基因富集分析(gene set enrichment analysis)是在一组基因或蛋白中找到一类过表达的基因或蛋白.研究方法可分为三种:Over-Repressentation Analy ...

任务选择p<0.05而且abs(log2FC)大于1的基因为显著差异表达基因集,对这个基因集用R包做KEGG/GO超几何分布检验分析. 把表达矩阵和分组信息分别作出cls和gct文件,导入到G ...

今天给大家介绍一个工具FunRich,FunRich (Functional Enrichment analysis tool) 是一个主要用于基因和蛋白质的功能富集和相互作用网络分析的独立的软件工具 ...

一个学徒跟着我做了七十多个转录组项目了,但是一直不能理解,凭什么这样的高通量筛选就能定位到具体的一两个基因. 为了帮助他理解生物学的混沌思想,我特意给他找了一个与2018年2月发表在CELL杂志的文章 ...

大家应该对通路富集分析都很熟悉,如DAVID.超几何富集分析等.都是在大量文章中常见的通路富集方法,给大家介绍一个更加复杂的通路富集分析的前期数据处理包GSVA(gene set variation ...

NetworkAnalyst3.0：差异基因筛选，功能富集分析、基因网络构建等功能于一体的在线基因表达分析工具