学徒作业-转录组差异基因筛选背景知识很重要 / 开普饭

由于化疗所致闭经的研究终点定义不一致,既往关于化疗期间促性腺激素释放激素激动剂戈舍瑞林保护卵巢功能的研究结果也不一致.抗米勒管激素(抗苗勒氏激素)和囊状卵泡计数被生殖医学专家认为是最敏感的卵巢储备指标 ...

对于三阴性乳腺癌患者,术后辅助放化疗仍然是唯一推荐的治疗方法.不过,对于T1N0M0期(肿瘤≤2厘米.淋巴结阴性.未远处转移)三阴性乳腺癌患者,现有证据似乎不足以推荐术后辅助放化疗. 2020年11月 ...

我喜欢把TCGA数据库的应用划分为8个领域: 1.探索各类肿瘤不同临床特征(性别.年龄.种族.临床分期)的预后(生存曲线) 2.探索各类肿瘤与对照的单个分子(mRNA,lncRNA,miRNA,甲基化 ...

hello大家好,小月亮又和大家见面了.上篇软文小月亮给大家介绍了NetworkAnalyst3.0工具的概览.这次小月亮就给大家详细介绍NetworkAnalyst3.0工具如何对单.多个基因列表数 ...

大家拿到基因数据,一头雾水不知如何下手,别急,咱们从差异基因筛选开始,一步步掀开数据分析的那层神秘面纱! 本文特别感谢 GCBI 算法工程师 Doctor Wang 的倾情解答! 对于基因的差异表达分 ...

编译:菜鸟菠萝,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读烟草是一种重要的经济农作物,叶片是重要的芳香生物活性化合物(如酚类和生物碱)的来源.在本研究中,采用无偏转录组学和代谢组学方法来鉴 ...

任务载入表达矩阵,然后设置好分组信息用DEseq2进行差异分析,也可以走走edgeR或者limma的voom流程基本任务是得到差异分析结果,进阶任务是比较多个差异分析结果的异同点. 了解差异基因 ...

背景介绍如果是bulk RNA-seq,那么现在最流行的就是DESeq2 和 edgeR啦,而且有很多经过了RT-qPCR 验证过的真实测序数据可以来评价不同的差异基因算法的表现. 对单细胞测序数据 ...

看到发表在 Cell. 2020 Mar 4. 的文章的研究项目里面有 4个10X样本,题目是:Complement Signals Determine Opposite Effects of B C ...

昨天我在生信技能树发布了一个学徒作业:在CCLE数据库里面根据指定基因在指定细胞系里面提取表达矩阵 , 真的是非常简单,只需要下载CCLE数据库的RNA-seq表达矩阵,然后在R里面根据指定基因在指定 ...

不知道多少人看完了全网第一个单细胞课程(免费基础课程),免费学习地址在B站:https://www.bilibili.com/video/av38741055 而且完成结业考核20题:https:/ ...

学徒作业-转录组差异基因筛选背景知识很重要