需要再战国自然？让这个16分的重磅数据库升级你的科研思路！ / 开普饭

导语 m6A是mRNA和lncRNA上最普遍的RNA修饰,也是哺乳动物中最显著的RNA修饰.它在各种生物学过程和疾病发病机理中起关键作用.最近的研究表明,m6A在包括病毒感染,压力,热休克和DNA损伤 ...

关于转录后调控,之前我们也介绍过很多这个方面的数据库了.其中包括一个我们之前介绍的综合性转录后分析数据库:[[POSTAR2-转录后调控预测网站]].恰巧最近这个数据库更新了3.0版本.所以我们今天就 ...

我们拿到一个lncRNA,想继续往下做时,一般都会想到从它的RNA结合蛋白(RBP)入手.因为RBP在多种细胞过程中起着最基本的作用,包括转录.RNA剪接和加工.定位.稳定性及翻译等.那么今天小编就来 ...

大家可以收藏一下. 数据库介绍 RNA-Seq Atlas - 通过下一代测序在正常组织中进行基因表达谱分析的参考数据库 RNA-Seq Atlas是一个基于网络的RNA-Seq基因表达谱和查询工具库 ...

编译:热血本能,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读现有的环状RNA(circRNA)数据库已成为转录组学必不可少的.但是,大多数方法都不适合挖掘候选circRNA优先级的深入信息. ...

一文学会circRNA机制探究神器circinteractone数据库大家好,我是火. 这里是火火的数据库解读专栏!继circbank数据库之后,这次我们再来谈一谈circRNA的机制问题.circ ...

导语 exoRBase是从人类血液外泌体的RNA-seq数据分析得出的环状RNA(circRNA),长非编码RNA(lncRNA)和信使RNA(mRNA)的存储库.exoRBase基于归一化的RNA- ...

导语外泌体(exosomes)是一类由细胞分泌的胞外囊泡结构,其内部包含有DNA,蛋白,脂类,RNA等信息.外泌体最早见于1981年, 科学家在体外培养的绵羊红细胞上清液中发现了有膜结构的小囊泡,并 ...

俗话说,好记性不如烂笔头,小编痛定思痛,决定先整理一份miRNA相关数据库的保姆级教程分享给大家,说不定哪天就用上了呢.好,上正餐! 1. TargetScan:http://www.targetsc ...

"胡,starbase是干嘛的?" "不就是预测miRNA与mRNA结合的数据库嘛." "还有呢?" "......" ...

一文学会集美貌与实力于一身的TANRIC数据库嗨,小伙伴们大家好!这里是弘毅专栏~每周一给大家分享一个数据库实操教程! 这次弘毅给大家带来的是一款集lncRNA注释和表达信息.可视化和临床相关分析等 ...

Starbase数据库于2011年上线,目前更新到3.0版本,开发者是中山大学RNA信息中心的屈良鹄研究团队.Starbase是做lncRNA/circRNA/microRNA等研究常用的强大数据库, ...

导语 RNA中存在着超过100种不同的化学修饰,包括N6-甲基化腺嘌呤(m6A)修饰.5-甲基化胞嘧啶(m5C)修饰.5-羟甲基胞嘧啶(hm5C)修饰.N1-甲基化腺嘌呤(m1A).次黄嘌呤.假尿嘧啶 ...

m6A是mRNA上最丰富的甲基化修饰,是RNA中腺嘌呤(A)上第6位N原子上的甲基,主要存在于mRNA的CDS区和3'UTR区,影响mRNA的稳定性,翻译效率,可变剪接和定位等.此外,长非编码RNA以 ...

CircRNA红透天际,引得一众科学家竞相追逐.然而眼下cirRNA研究的一个巨大挑战就是,可参考信息不多,数据库建设相比其他非编码(miRNA,lncRNA)相对稚嫩. 而数据库使用教程更是稀少,质 ...

m6AVar! 1.打开网站首页http://m6avar.renlab.org/index.html. 2.类似前面的,下拉菜单有RsID, Gene, Region和Disease可供选择,我们以 ...

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