最全最细致的circRNA数据库使用指南，学完秒变circRNA研究达人 / 开普饭

一个文章套路的小故事 TCGA原始的数据库只有表达组学.甲基化.临床信息这些数据,所以大家在挖掘数据,最基本的就是在这几个组学里面来回的交叉融合.如果一个癌种别人交叉分析了,那其实基于基础的思路很难再 ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2464天又一挖掘lncRNA信息的宝藏网站. RNA测序(RNA-Seq)技术是近年来发展和应用迅速的二代测序技术,它促进了基因研究,并被应用于多种癌症研究,为研究选择 ...

Starbase数据库于2011年上线,目前更新到3.0版本,开发者是中山大学RNA信息中心的屈良鹄研究团队.Starbase是做lncRNA/circRNA/microRNA等研究常用的强大数据库, ...

大家可以收藏一下. 数据库介绍 RNA-Seq Atlas - 通过下一代测序在正常组织中进行基因表达谱分析的参考数据库 RNA-Seq Atlas是一个基于网络的RNA-Seq基因表达谱和查询工具库 ...

YM500v2是用于个人smRNA-seq数据集的miRNA定量,是miR鉴定和新型miRNA预测的集成数据库.YM500v2中包含了YM500之后开发的与miRNA相关的新算法,更重要的是,纳入了8 ...

第一单元 lncRNA数据库长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码RNA.研究表明, lncRNA 在剂量补偿效应.表观遗传调 ...

m6A(N6-methyladenosine,6-甲基腺苷)是真核生物中最常见最丰富的RNA修饰,作为一种可逆修饰,RNA既可以在甲基化转移酶METTL3/14 等酶的作用下发生m6A甲基化修饰,又可 ...

一文学会circRNA机制探究神器circinteractone数据库大家好,我是火. 这里是火火的数据库解读专栏!继circbank数据库之后,这次我们再来谈一谈circRNA的机制问题.circ ...

编译:热血本能,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读现有的环状RNA(circRNA)数据库已成为转录组学必不可少的.但是,大多数方法都不适合挖掘候选circRNA优先级的深入信息. ...

我们在进行公共数据挖掘的时候,经常会碰到要对多个数据集联合分析的时候,如果想要把这些数据放到一起进行分析的话,那么首先还是需要先去除批次效应才能进行分析的.之前我们的介绍的数据库的时候,也提到了两个和 ...

导语环状RNA(circular RNAs, circRNA)是一类由 mRNA 前体经反向可变剪切而来的共价闭合且保守的单链转录本,长度跨度从几十bp到几千bp,在表观遗传及各种细胞过程中发挥重要 ...

本期直播主题:国自然放榜了,又没轮到我,该为了明年申请做点什么? 点击预约按钮,领开播好礼! 解螺旋公众号·陪伴你科研的第2667天重磅数据库 RNA结合蛋白(RBP)在转录后的调节中起着关键的作用 ...

"胡,starbase是干嘛的?" "不就是预测miRNA与mRNA结合的数据库嘛." "还有呢?" "......" ...

miRNA作为ncRNA的一类.其主要发挥功能的主要方式是通过和基因形成双向互补链进而来影响基因的表达.因此通过miRNA和基因序列是否互补就可以遇到miRNA可能的靶基因了.这个基本上就是经典的预测 ...

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