人类lncRNA的表达数据库 / 开普饭

编译:小北,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 D-柠檬烯是从柑橘油中提取的天然物质,据报道具有抗癌的疗效并且在癌症患者中预后良好.尽管作为癌症化学预防物质,人类中D-柠檬烯的转录图 ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2422天一站式的肿瘤lncRNA数据库肿瘤的转移是肿瘤治疗领域的一大难题,也是肿瘤研究方向上的一个重要方向.2019年,我们公众号曾在推送<真的是超好用的肿瘤研 ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2408天关系再复杂,看完也门清! 长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在人类转录组中占到了相当大的比例. 大量lncRNA在肿瘤中特 ...

如果我们最后拿到的是蛋白编码基因,当然可以很容易的注释到各种数据库,比如:Gene Ontology terms, KEGG, Reactome, NetPath, PID, INOH and Bio ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2415天 lncRNA数据库中的多面手由于今天这款lncRNA数据库实在是重磅,我就直接告诉大家吧,不管你是做基础研究还是做疾病研究,不管你是研究肿瘤还是非肿瘤,不管你 ...

细胞外囊泡存在于所有类型的体液中.已有的研究表明细胞外囊泡在大多数生理和病理状态下发挥功能,能够作为细胞间通讯的载体.但是,细胞外囊泡在精子发生.活力维持及相关疾病中的研究报道还较为少见,相关的全转录 ...

非编码RNA,根据其长度的不同可分为长链非编码RNA和短链非编码RNA.长链非编码并不编码蛋白,而是以RNA的形式在多种层面上(表观遗传调控.转录调控以及转录后调控等)调控基因的表达水平.研究表明,l ...

写在前面我们在进行基因的蛋白表达检测的时候,通常的方法是进行western blot以及免疫组化进行检测的.对于这两个实验都是需要提前买抗体进行检测的,但是抗体又贵,如果一个基因检测的结果不好的话, ...

有VIP学员咨询我们,该如何整理人类的lncRNA信息做数据挖掘呢? 正好我看到一款商业芯片 Arraystar Human LncRNA Array V4.0 ,上面介绍: Arraystar Hu ...

GTEx数据库想必大家并不陌生了,通常我们在挖掘TCGA数据库的时候,会发现该项目纳入的正常组织测序结果是非常少的,也就是说很多病人都不会有他的正常组织的转录组测序结果. 比如说乳腺癌吧,1200个左 ...

导语环状RNA(circular RNAs, circRNA)是一类由 mRNA 前体经反向可变剪切而来的共价闭合且保守的单链转录本,长度跨度从几十bp到几千bp,在表观遗传及各种细胞过程中发挥重要 ...

希望所有学员都可以站在生信技能树的舞台上发光发热! 前些日子(个把月前),合作伙伴发给我他翻译整理了eLife杂志的综述:<Beyond the RNA-dependent function o ...

对于转录因子预测而言,我们昨天的数据库介绍当中也提到了.转录因子主要是通过识别DNA序列当中的基序(motif)来调控目标基因的.所以其实我们在知道了一个基因的motif的时候就差不多能找到这个转录因 ...

目前大部分lncRNA相关的数据库都是依赖高通量测序,而今天我们介绍的这个数据库以实验验证为基础,收集2016年5月1日前的所有lncRNA实验数据,并整合了lncRNAdb, LncRANDisea ...

单核苷酸多态性(SNP)的变化,可以影响基因的的调控.如果这个SNP又正好位于lncRNA上,那么就是这个SNP可能调控lncRNA的功能了. lncRNASNP2(http://bioinfo.li ...

人类lncRNA的表达数据库