上下调基因各自独立进行GO数据库的3分类富集(求美图代码) / 开普饭

今天要介绍的这篇章是我们中国人写的,发表在Med Sci Monit上,这篇文章主要是通过下载GEO和TCGA的数据,通过差异表达分析,GO富集分析.KEGG富集分析,PPI分析,COX回归分析,筛选 ...

从小白的角度,30分钟复现生信套路.今天为大家带来一篇2020年9月发表于International Journal of Chronic Obstructive Pulmonary Disease的 ...

研究背景: 卵巢癌在全球与妇科癌症相关的死亡中排名第五.到目前为止,尚未完全了解卵巢癌的肿瘤发生和预后的分子机制.这项研究旨在发现参与卵巢癌的hub基因和治疗药物. 研究方法: 从Gene Expre ...

GSEA(Gene Set EnrichmentAnalysis),即基因集富集分析,无需设定阈值来区分上调下调基因,使用所有的基因进行分析. GO 和 KEGG 可参考:R|clusterProfi ...

我们通常画热图都是这个样子,发文章没有什么问题: 但是很多时候我们想区分上下调基因,让人一看就能看出哪些是上调基因,哪些是下调基因,我们可以进行一下区分的. 代码很简单的,关键点是数据准备,代码可以随 ...

如果你想计划一次最轻松.浪漫.出片率高的海滨城市自然风光之旅,27个特色地标,18位NiSi地标摄影师,用108张美图强烈推荐你一定要来-珠海! [地标:情侣路香炉湾] 1.6秒 F8 ISO10 ...

梅,又名梅别名春梅.干枝梅.酸梅.乌梅, 蔷薇科.杏属小乔木,稀灌木,树皮浅灰色或带绿色,平滑:小枝绿色,光滑无毛.叶片卵形或椭圆形,梅原产我国南方.枝干挺秀,花色雅丽,清香扑鼻,在百花凋谢的冬季,傲 ...

网曝蕾拉小姐分手男友搭上女模陈赫前妻许婧被曝与外籍男友分手,男友疑似搭上<爱上超模>中的女模特彦禹博,两人一同做饭十分甜蜜.2016年6月,许婧承认交往外籍男友,随后男方被曝出吸大麻. ...

看到一篇文章提到了这个分析,其实这样的分析已经常规化了. 文章链接:https://www.nature.com/articles/s41467-018-04987-y 重点是作者对自己的生物学领域背 ...

最近看到某公司宣传他们的科研服务产品,是miRNA的芯片,而且文章居然是2011发表的,那个时候我还不知道生信是啥子.(我一直以为自己足够老了) 该研究使用的是 CapitalBio 平台 (Capi ...

转录因子(Transcription Factor, TF)及其靶基因在人类疾病和生物学过程中起重要作用,转录因子敲降/敲除前后的基因表达谱分析是获得转录因子靶基因.探索转录因子功能的最重要策略之一. ...

一个转录因子能同时控制多个基因的表达,同时转录因子的功能作用也可能受多个调控因子的影响.Cistrome DB就是这样的一个数据库,可以展示转录因子的相关调控内容. Cistrome DB历年样本数据 ...

外泌体是多泡体限制性膜与细胞质膜融合而释放的脂质双层膜囊泡,能够运载其内源性的蛋白质.脂质.核酸.miRNA 等信息物质参与细胞间通讯和机体的生理代谢过程,被认为是细胞间通讯.疾病诊断和预后循环生物标 ...

上下调基因各自独立进行GO数据库的3分类富集(求美图代码)