如何用R获取GEO样本信息 / 开普饭

GEO虽是一个宝库,但是使用GEO进行数据分析可不是一件简单的事! 首先,GEO的数据检索非常不方便,例如,我想获取有预后信息的乳腺癌数据,显然使用GEO官方检索起来很难. 其次,GEO大部分数据都基 ...

昨天我们GEO数据库的检索方式.但是对于里面的每一个数据集内容没有详细的解释,这次呢,我们就来介绍一下每个数据集里面包括哪些内容. 这次我们用GSE79973数据集进行介绍.(https://www. ...

#1. GEO数据的下载 ##1.1 方法一:下载RAW Data数据 ##1.2 方法二:下载series Matrix表达数据 rt <- read.table("GSE56814 ...

欢迎来到医科研,这里是白介素2的读书笔记,跟我一起聊临床与科研的故事, 生物医学数据挖掘,R语言,TCGA.GEO数据挖掘. 这一节的内容包括应用 GEOquery包下载芯片数据,提取表达矩阵,提取m ...

#如何用excel获得股票实时数据# 首先找一个提供股票数据的网站,各种财经网站都有股票数据,我们以东方财富网为例: 沪深A股数据,我们在谷歌浏览器中查看真实网址: 找到jQuery行,对应的就是股票 ...

信息是什么? 信息,指音讯.消息.通讯系统传输和处理的对象,泛指人类社会传播的一切内容.人们通过获得.识别信息来区别事物,以认识和改造世界. 1948年,数学家香农在"通讯的数学理论&quo ...

塔吉克斯坦最高法院院长谢尔穆罕默德·舒赫永 2021年5月15日,(杜尚别,夏冉译)据"亚洲快讯"的报道称,塔吉克斯坦下议院议会议员对塔吉克斯坦共和国政府提出的"关于获取 ...

由于目前市面上出版的中国地图仍以1989年的国界线为准,因此即便之后中国与周边国家陆续签订了边界协定,完成了边界划定工作,但是有些边界划定并未在现行出版的地图上进行反映或更新,所以我们迄今会看到国内出 ...

文:禅卡塔罗写这篇文章,起源于我最早的一个客户,因为在面临困惑的时候,大家不知道怎么去用好这个牌,主要原因是这个市面上还没有塔罗师真正的去写这类型文章,而我陆续的会给大家去科普一些内容. 点击此处添 ...

# 1. GEO数据下载 ----------------------------------------------------------------- rm(list=ls()) #清空环境 ...

# 2. 提取表达和临床信息 --------------------------------------------------------------- ##2.1 通过pData函数获取分组信息 ...

如何用R获取GEO样本信息