综述:高维单细胞RNA测序数据分析工具(下)
相关推荐
-
Nat Commun:乳腺癌单细胞测序深度解析
Single-cell RNA-seq enables comprehensive tumour and immune cell profiling in primary breast cancer利 ...
-
NATURE 子刊 | 美国约翰霍普金斯大学:空间转录组学使全基因组的表达成为可能 (1区 IF 7.16)
编译:冬日暖阳,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 美国约翰霍普金斯大学医学院K. R. Maynard等人于2019年8月23日在医学国际权威期刊Neuropsychopharmacol ...
-
综述 | 沃里克大学Charlotte Rich-Griffin等:单细胞转录组学:植物功能基因组学的高分辨率之路
编译:卡德加,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 植物功能是单个细胞在不同组织中协同作用的结果.RNA-seq测序技术和组织处理技术的进步使研究者能够捕获单细胞分辨率下的转录变化.单 ...
-
科研 | CURR OPIN BIOTECH:单细胞转录组学方法学和应用综述(1区IF:8.083)
编译:罗睺,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 单细胞RNA测序(scRNA-seq)是研究脑和中枢神经系统(CNS)中单个细胞转录组的一种有前途的方法.这项技术充当了神经科学,计算 ...
-
Cancers 6 |单细胞测序泛癌分析
实体瘤肿瘤特异性免疫预后特征及其与免疫检查点治疗的关系 首先让我们通过摘要了解下这篇文章的主要内容,为了阐明免疫细胞浸润作为实体肿瘤预后标志的作用,作者分析了四个公开的单细胞RNA-Seq数据集和TC ...
-
综述 | Nature子刊:单细胞和单核RNA测序方法的系统比较
编译:艾奥里亚,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 近年来,随着单细胞RNA测序方法的规模和能力迅速扩大,这使得重大发现和大规模细胞测绘工作成为可能.但这些方法还没有得到系统和全面的 ...
-
PNAS | 单细胞转录组测序揭示了人类TCRVδ1和TCRVδ2γδT淋巴细胞共有的和独特的细胞毒性特征
推荐:江舜尧 编译:多儿 编辑:马莉 法国图卢兹癌症研究中心学者Jean-Jacques Fourniéa等人于2019年5月22日在<PNAS>上发表题目为<Single-cell ...
-
超长综述|单细胞RNA测序研究动脉粥样硬化指南
编译:刘娟,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 单细胞水平的分子异质性研究技术加深了我们对包括动脉粥样硬化斑块在内的组织中细胞生物多样性的了解.现有的商业化系统能从成千上万个单细胞中 ...
-
综述:高维单细胞RNA测序数据分析工具(上)
文章信息 Author:Yan Wu and Kun Zhang Date:2020 Mar 27 Journal:Nat Rev Nephrol(IF:19.684) 摘要 在单细胞水平上对转录组进 ...
-
综述:高维单细胞RNA测序数据分析工具(中)
当你的才华还撑不起你的野心时,请潜下心来,脚踏实地,跟着我们慢慢进步.不知不觉在单细胞转录组领域做知识分析也快两年了,通过文献速递这个栏目很幸运聚集了一些小伙伴携手共进,一起成长. 文献速递栏目通过简 ...
-
你值得拥有的单细胞RNA测序分析工具TOP 3
RNA测序相信大家已经接触到不少了,它的样品通常来自研究某一组织细胞群.这些细胞被认为是同质的,也就是说每一个细胞内的表达水平被认为是相似的.但事实上细胞之间的异质性的很普遍的,RNA测序最终将表达量 ...
-
单细胞RNA测序综述汇总—肿瘤研究的新工具
摘要 各种形式的肿瘤内异质性和复杂性会影响抗肿瘤治疗的疗效,导致治疗耐药性和转移.而近年来兴起的单细胞测序技术,结合数据整合方法的创新,使得精细理解肿瘤及肿瘤微环境中细胞间的相互作用,表征疾病进展过程 ...
-
高分综述 | 美国斯坦福大学:单细胞RNA测序在心血管发育、疾病及心血管医学中的应用
编译:KT!,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 单细胞RNA测序技术在过去10年间的先进发展为生物医学研究带来了变革性的影响,使得单细胞转录组的分析获得了前所未有的分辨度和通量.单 ...
-
综述 | Mucosal Immunology:单细胞RNA测序分析揭示藻酸盐寡糖可预防化疗引起的粘膜炎(国人作品)
编译:有点卡,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 目前全世界癌症的发病率持续增加,约40%的癌症患者接受化疗,一种常见的副作用也伴随而生-胃肠道粘膜炎,通常表现为小肠绒毛缩短,粘膜上 ...
-
科研 |NAT COMMUN:单细胞RNA测序鉴定通过双电位中间产物形成的早期感觉神经元的多样性
编译:胡胡,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 躯体感觉是由多种初级感觉神经元的存在定义的,这些神经元具有独特的生物学特征以及对外部和内部刺激的反应特征.然而,关于细胞状态的多样性是 ...
-
科研 | Cell:单细胞RNA测序揭示治疗诱导的人类肺癌进化
编译:阿温,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 肺癌是导致癌症患者死亡的主要原因,它表现出的异质性使其具有适应性,限制了治疗的成功,且仍没有被完全了解.本研究采用30名转移性肺癌患者 ...