拼凑6个网页工具图表还不够那就再加上6个组学 / 开普饭

目前,cBioPorta.GEPIA等现有生物学工具为基因表达分析提供了许多有用的可视化和分析工具,但是并不能充分解决实验生物学家要求的其他一些快速分析.例如,根据初步结果选择特定的细胞系进行进一步研 ...

关于TCGA表达数据的分析.之前我们我们介绍过.目前可能用的最多的也就是GEPIA了.之前在GEPIA2发表的时候(GEPIA I, GEPIA II),我们对这个数据库进行了介绍.最近.GEPIA的 ...

昨天介绍的TC3A是基于TCGA肿瘤数据来进行分析的,而这次的这个APA atlas (https://hanlab.uth.edu/apa/)则是基于GTEx的数据来分析的.如果不清楚TCGA和GT ...

第一步,下载GEO数据库的环状RNA和miRNA.mRNA数据第二步,分别对环状RNA和miRNA.mRNA数据做差异分析(多个数据集取交集) 第三步,挑选出重要的环状RNA预测下游的miRNA,预 ...

相信绝大多数研究肿瘤的科研工作者的工作都离不开某个特定的基因,现在绝大部分的单基因的生信文章也都有这么一个图,我就随便列举一些文章的Figure1 比如再比如再比如再比如再比如再比如再比如 ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2533天 7+纯生信ceRNA文章复现在pubmed搜索ceRNA,发现很多实验类的文章,做了很多内容,但是只发了2-3分,所以今天想和大家一起学习2021年1月发表于 ...

前几天一直在和大家分享一些关于3'UTR以及3'UTR当中的APA(Alternative Polyadenylation, 选择性多聚腺苷酸化)的内容,为什么要花这么久的时间分享这些呢?主要还是看到 ...

GEPIA(http://gepia.cancer-pku.cn/index.html)这个工具可以说是分析TCGA数据库数据分析工具中比较简单好用的工具了,包括生存分析,表达差异分析,相关性分析等, ...

我们在进行数据库介绍,尤其是肿瘤相关数据库的时候,经常会提到说这个使用了 TCGA/GTEx 数据库的数据,那么这两个数据库到底是什么呢?为什么会有用这两个数据库呢?另外呢,由于最近ICGC提的也比 ...

UALCAN:(http://ualcan.path.uab.edu/index.html)是一个综合的.用户友好的.交互式的web资源,用于分析癌症组学数据.UALCAN的设计目的是: 提供对公开的 ...

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