”基因集打分“GSEA算法详解 / 开普饭

随着高通量测序的越来越火,对于一个基础实验而言,往往第一步都是需要做点儿高通量测序,来发现一些新的东西,才能往下做.如果不这么做的话,好像就感觉差人一步似的.尤其是对于新兴的一些RNA.比如circR ...

富集分析基因富集分析(gene set enrichment analysis)是在一组基因或蛋白中找到一类过表达的基因或蛋白.研究方法可分为三种:Over-Repressentation Analy ...

大家应该对通路富集分析都很熟悉,如DAVID.超几何富集分析等.都是在大量文章中常见的通路富集方法,给大家介绍一个更加复杂的通路富集分析的前期数据处理包GSVA(gene set variation ...

ssGSEA顾名思义是一种特殊的GSEA,它主要针对单样本无法做GSEA而提出的一种实现方法,原理上与GSEA是类似的,不同的是GSEA需要准备表达谱文件即gct,根据表达谱文件计算每个基因的rank ...

和其它文章初衷一样,网上解释很多,但是讲的不是很明白,在看完几篇参考博客后特此记录简介先拿语音识别任务来说,如果现在有一个包含剪辑语音和对应的文本,我们不知道如何将语音片段与文本进行对应,这样对于 ...

下面的99%的代码都是手动敲出来的,参考了诸多资料,已经经过测试,可以放心食用. 1.冒泡排序基本思想冒泡排序基本思想是依次比较两个相邻的元素,如果顺序(如从大到小.首字母从Z到A)错误就把他们交 ...

本文详细描述了当前代码中(git 版本: 16b521b12d2e3bdc00bd996acafe4526f1d1cb9a)道路识别的算法. 如果没有特殊说明,下文中所说的"算法" ...

建筑工程人 11篇原创内容公众号一模板的计算一.根据混凝土量快速估算模板用量 1.适用情况:一般用于工程开工前期,在已知混凝土用量的情况下估算模板用量,以初步估算工程周转材料成本投入数量,为筹措 ...

老哥唠叨上一篇发了MySQL主从复制集群搭建流程,不过好像小伙伴们对这个文章并不感兴趣,但是老哥出于对技术的热爱,和对小伙伴们的负责,我还是要写主从复制另一种实现方式:GTID.这些技术真的蛮重要的 ...

在以前的OCR任务中,识别过程分为两步:单字切割和分类任务.我们一般都会讲一连串文字的文本文件先利用投影法切割出单个字体,在送入CNN里进行文字分类.但是此法已经有点过时了,现在更流行的是基于深度学习 ...

spectral clustering,称之为谱聚类算法,和近邻传播AP算法一样,也是基于图论的算法,都是将样本点两两相连,构成图这一数据结构,不同的是,谱聚类是通过切图的方式来划分不同的cluste ...

Affinity Propagation简称AP, 称之为近邻传播算法, 是一种基于图论的聚类算法.将所有样本点看做是一个网络中的节点,图示如下在样本点构成的网络中,每个样本点都是潜在的聚类中心,同 ...

DBSCAN算法对于邻域半径eps和最小样本数minPoints这两个参数比较敏感,不同的参数取值会产生不同的聚类效果.为了降低参数设置对聚类结果造成的不稳定性,在DBSCAN算法的基础上,提出了OP ...

”基因集打分“GSEA算法详解