16s分析之进化树+差异分析（二） / 开普饭

# 6. 可视化展示 ---------------------------------------------------------------- ##6.1 火山图 library(ggplot ...

之前我便说过,16s出图主要是用R,自这两年来Y叔的ggtree出来,好评不断,引用不断攀升这里当然借用Y树的包来做我们的进化树,当然Y叔公众号讲的更加深入和详细,有需要请关注:biobabble ...

对otu的差异分析并不是我们唯一的选择,差异往大的做,可以往往门,纲,目,科做. 今天要做一张长的图,我们可以和别的图一起配合使用会好? 比如这篇文章,还是挺好看的: 下面是一份完整的代码,我仅仅只做 ...

今天我们来学习R语言DESeq2包,原理什么的后不说,在操作过程中点缀一下,等四个差异包推送完成后,咱们在对这四个包做差异分析的原理做一个比较分析: 这个包适用于: 高通量数据分析过程中,基于coun ...

之前做 LEfSe 分析,使用全部的六个等级分类数据,总观测达到 1500,做出来树图很不好看,因此这次做一下调整: 1. 选择相对丰度在 0.001 以上的观测: 2. 将每个等级没有注释上名称 ...

分析人物形象及作用: (2019三州联考)阅读下面文字,回答1-3题.(12分) 火车侠火车侠是我见过的最特别的一个人. 我记得是在高中的某节课上,我正被讲台上的老师念叨得昏昏欲睡,旁边一个女生悄悄 ...

2008/10/08 趋势在什么时间会出现多大级别的调整,相信这是人人关心的问题.有时候我们会发现,有些调整行情的级别非常小,可能几天就调整完毕.而有些时候却需要数周甚至数月的调整. 那么,趋势开始出 ...

福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现决定安排扩增子16S分析.宏基因组.转录组的线上/线下同时开课.报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线下课 .期待和 ...

几乎每个女人都对未来另一半充满幻想,希望是个称心如意的白马王子,然而命运是很残酷的,缘分到来的时候,很多事情都会身不由己,由不得自己选择,所以我们可以来看看传说中注定要嫁个二婚男的八字是什么样的,看看 ...

俄亥俄州立大学Ann L. Griffen等人于2018年9月5日在<Microbiome>发表了题目为<High-resolution ISR amplicon sequencin ...

16s分析之进化树+差异分析（二）