过滤线粒体核糖体基因 / 开普饭

先看看MSigDB中的基因ENTREZID是否可以全部转化为SYMBOL. library(biomaRt)library(clusterProfiler)library(org.Hs.eg.db)l ...

如果你看了我的单细胞转录组数据分析的基础10讲: 01. 上游分析流程 02.课题多少个样品,测序数据量如何 03. 过滤不合格细胞和基因(数据质控很重要) 04. 过滤线粒体核糖体基因 05. 去 ...

在一项新的研究中,来自瑞典斯德哥尔摩大学.卡罗琳斯卡研究所.美国国家糖尿病.消化及肾脏疾病研究所.迈阿密大学.芬兰赫尔辛基大学和英国纽卡斯尔大学的研究人员利用英国钻石光源(Diamond Light ...

因为损坏细胞和死细胞常表现出过大量的线粒体污染,因此需要过滤高线粒体基因表达的细胞.过滤原则为,移去线粒体基因表达比例过高的细胞,但是不能大量丢失样本细胞信息. library(Seurat) lib ...

如何删除线粒体基因表达过高的细胞 Part1:加载包并读入Rdata文件读入Rdata文件并查看Rdata文件保存的变量查看保存变量名后,读入Rdata文件 Part2:对多样本中的每个样本查看质 ...

哺乳动物细胞的线粒体的一个重要功能是通过氧化磷酸化为细胞提供大部分的ATP,此外,线粒体可以整合各种代谢途径,并通过这一过程产生用以合成细胞生物质能所需的中间产物,此外,线粒体还参与维持细胞质和线粒体 ...

假设某次实验芯片上的某个基因在两个样本里面都没有检出,但是根据背景信号分析,计算得到的信号值分别为0.01,和0.1,在仅仅分析差异倍数的时候,该基因的差异倍数达到10倍以上,但是这个差异倍数其实是没 ...

编译:秋秋糖,编辑:Tracy.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读过氧化物氧化还蛋白6(PRDX6)与肿瘤进展和肿瘤转移密切相关.它对磷脂氢过氧化物的作用及其磷脂酶-A2活性在过氧化还蛋白家族 ...

植物细胞器,包括线粒体和叶绿体含有自己的基因组,它们分别编码许多对呼吸和光合作用必需的基因. 植物细胞器中的基因编辑是对植物遗传学和生物技术的未满足需求,因缺乏适当的工具来阻碍这些细胞器中的DNA. ...

编译:微科盟Nelly,编辑:微科盟悄咪咪.江舜尧. 微科盟原创微文,欢迎转发转载. 导读目前,关于核基因组在维持线粒体基因组(mtDNA)稳定性中扮演什么样的角色尚不清楚.mtDNA序列变异可以异 ...

过滤线粒体核糖体基因