一文教会你查找基因的启动子、UTR、TSS等区域以及预测转录因子结合位点 / 开普饭

编译:思越,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读肿瘤微环境(TME)是无数信号分子形成的复杂网络,给人类癌症的新型治疗靶标识别带来了挑战和机遇.MicroRNA(miRs)由于其在不 ...

人类基因组中有关于疾病变异的研究已经取得了巨大的进展.然而,非编码基因组中的变异仍然需要更多的探索.非编码基因的变异可通过多种机制导致疾病,例如破坏顺式调控元件.干扰非编码转录物的功能等.事实上,虽然 ...

导语 TargetScan是一款预测miRNA结合位点的软件,对于哺乳动物中miRNA结合位点预测的效果非常好.在预测miRNA靶基因之前,首先需要确定转录本的3'UTR区域,TargetScan数据 ...

推荐:江舜尧编译:荟氚编辑:马莉康奈尔大学分子生物学和遗传学系John T. Lis等共同于2019年8月9日在Nature Reviews Genetics 上发表了题名为<Nasce ...

编译:卡德加,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读哺乳动物基因的RNA转录物的加工过程在其转录位置附近进行.该研究中,科研人员发现了一种影响成千上万个基因的现象,称之为外显子介导的转 ...

2021年7月22日,英国kim E. hammond-kosack团队在国际知名期刊Plant Biotechnology Journal在线发表题为"Exploring the dive ...

和甲基化有关的. 可以先了解下甲基化: 450k甲基化基础 450K甲基化芯片数据处理传送门 450k甲基化芯片常用工具包:ChAMP和minfi等. 甲基化的一些预备知识甲基化程度的量化 imag ...

可以在ensembl中进行基因3'-UTR序列的下载在download sequence中选中3'-UTR下载即可

在医学文献中,经常会发现以基因名+突变信息命名的SNP,如UGT1A9*3 98T>C,如果我们要找到这个在染色体上的位置.对应的rs编号.或者要提取序列进行sanger测序验证时,这样命名的突 ...

!!!!,注意上图是**顺式作用元件在启动子上的批量可视化,当然最后坐标要自己调,直接全部-2000bp,5' 和 3' 替换 ** 写在前面以前总看到问题是,基因结构可视化的问题:现在则变成了启动 ...

做完转录组分析完之后,一般会找到一些差异表达的基因.差异表达基因中如果有转录因子的话,可以研究一下转录因子调控哪些基因的表达.要预测转录因子调控的靶基因,需要两个步骤: 1. 首先需要知道转录因子的结 ...

图:人结肠癌细胞的细胞核染色为红色,E-钙粘蛋白染色为绿色.资料来源:NCI癌症研究中心. 一项新的研究发现,血液检测可以根据预测天气的相同原理预测肠道肿瘤对治疗的反应时间. 血液检测或者" ...

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宫颈癌作为四大常见癌症和世界上第二大最常见的妇科恶性肿瘤,据环球观察称,2018年全球约有57万例新发病例,超过31.1万万例死亡.宫颈癌起源于正常的上皮下包,有明显的形态学改变,包括两种主要的组织类 ...

在作物驯化和改良过程中选择的几个与产量相关的性状1,2与分生组织大小3有关,这由CLAVATA–WUSCHEL途径中的CLE肽信号控制. 本研究利用CRISPRCas9基因组编辑技术,构建了玉米CLE ...

刘如谦参与创办的又一家公司正式露面. 近日,Prime Medicine 宣布完成 3.15 亿美元的融资,用于快速推进临床适应症.扩展平台的功能,以利用其独有的 prime editing 技术为患 ...

放一张效果图,这些,三四年前的东西,我其实一直懒得说. 写在前面 "Gene Structure View (Advanced)"这个功能可以说,也是一时兴起写出来的.开发的主要动 ...

一文教会你查找基因的启动子、UTR、TSS等区域以及预测转录因子结合位点