GEO\TCGA纯生信数据挖掘经典套路

相关推荐

• 非肿瘤易学的2+分方案

  您的SCI选刊助手!今天给大家分享的是一篇2+分的学习笔记.这篇学习笔记通过差异表达基因(DEGs)筛选.加权共表达网络分析(WGCNA).GO和KEGG富集分析.PPI网络分析确定枢纽基因.验证枢纽 ...

• GEO+TCGA数据挖掘+收集临床样本的思路

  研究背景: 肺腺癌(LAD)是最普遍的肺癌类型.据报道,UDP-N-乙酰氨基葡糖焦磷酸化酶1(UAP1)的异常表达与癌细胞的许多生物学过程有关,但尚不清楚LAD中UAP1的表达. 研究方法: 生物信息 ...

• 如何筛选基因加上简单分析就能3+分？

  Identification of Genes Related to Clinicopathological Characteristics and Prognosis of Patients wit ...

• 铁死亡经典思路，真香无疑

  大家好呀!今天跟大家分享一篇2021年6月发表在International Immunopharmacology(IF:4.932)上的文章.本篇文章主要基于头颈部鳞状细胞癌患者的铁死亡相关基因构建预 ...

• 非肿瘤方向一样可以做数据挖掘

  这篇文章的思路:1.对GSE22491进行差异分析,画一下火山图和热图:2.主成分分析:3.富集分析:4.PPI分析 论文题目 Gene expression profiling predicts p ...

• GEO联合TCGA数据挖掘文献分享

  今天要介绍的这篇章是我们中国人写的,发表在Med Sci Monit上,这篇文章主要是通过下载GEO和TCGA的数据,通过差异表达分析,GO富集分析.KEGG富集分析,PPI分析,COX回归分析,筛选 ...

• Meta分析该如何搭上lncRNA?

  论文题目 Potential role of LINC00996 in colorectal cancer: a study based on data mining and bioinformati ...

• 自建队列简单分析发7+分思路

  Comprehensive RNA Sequencing in Adenoma-Cancer Transition Identified Predictive Biomarkers and Thera ...

• 做生信数据挖掘一定要会编程吗

  自从meta分析贬值了之后,生信数据挖掘成为了国内医生.研究生.博士.教师火爆的发文神器,可是令人头痛的事情来了,生信往往需要学习编程,其中R就必不可少,如果要挖TCGA.SEER,Perl或者Pyt ...

• 4+分干湿结合模板：简单分析简单实验

  Identification of potential novel differentially-expressed genes and their role in invasion and migr ...

• 这个不用版面费的期刊牛呀，这么简单的纯生信也敢接收

  今天看到一个不用版面费的期刊竟然出版了一篇非常简单的纯生信数据挖掘的文章,这篇文章就做了GEO数据的差异分析.GO富集分析.KEGG富集分析.PPI分析,连生存分析都没有做的.这个不用版面费的期刊就是 ...