Fluidigm C1单细胞转录组和bulk转录组比较
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双剑合璧|scRNA-seq与bulk RNA-seq联合分析
Bulk RNA-seq 和single cell RNA-seq的最主要区别在于单细胞测序代表单个细胞(single cell),而bulk测序代表一群细胞(a population of cell ...
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仅3个单细胞测序样本纯分析也发6分!
Single-cell RNA sequencing of human kidney 人肾脏的单细胞测序 一. 研究背景 肾脏是在结构和功能高度复杂的器官,而其结构和功能的复杂性与其众多的细胞类型相关 ...
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单细胞可以跟bulk转录组结合起来
记得上半年参加某个单细胞会议,深圳某医院科研负责人(院长吧)豪气的说,大家尽管来我们医院,保底50万年薪,而且咱们这里单细胞平台全部搭建好了,以后只做单细胞,所有之前使用bulk转录组的实验统统换成单 ...
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如果传统bulk转录组数据队列足够大也可以使用单细胞流程
还给出了一些简单代码,就是看看样本聚类情况,然后留成作业给另外一个学徒,看单细胞R包Seurat的FindAllMarkers函数对7个亚型找到的marker基因,根据传统的bulk转录组差异分析策略 ...
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单细胞转录组研究的同时也可以加上传统bulk转录组
在朋友圈刷到了这个文章,2020年1月4日,中国医学科学院北京协和医学院朱兰及中国科学院北京基因组研究所杨运桂共同通讯在Nature Communications 在线发表题为"Single ...
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自己没有测bulk转录组数据难道不会找公共数据吗
这样就非常好的应用到了单细胞技术的优点,但有粉丝留言提问说自己设计单细胞转录组课题比较早,那个时候没有看到这个 2021 年1月4日,中国医学科学院北京协和医学院朱兰及中国科学院北京基因组研究所杨运桂 ...
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10X单细胞(10X空间转录组)数据分析之细胞过滤那些事
hello,大家好,今天已经是五一假期的第二天,本人呢,哪也去不了,只好在家歇着,所以呢,给自己找点事做,本人93年,单身,现居天津武清,女孩子有没有想谈恋爱了,可以联系我,联系方式是.......咳 ...
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基因表达实现“3D”可视化,空间转录组学将是单细胞分析之后的又一波热潮
空间转录组学技术自斩获了 Nature Methods 2020 年 "年度技术" 以来,引起更加广泛的关注.这种技术结合了成像和测序技术,能够绘制组织上特定转录物存在的位置,从而 ...
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科研│CELL:大规模单细胞转录组图谱揭示新冠肺炎的免疫特征(国人佳作)
编译:微科盟 逍遥君,编辑:微科盟景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 2019年新型冠状病毒(新冠肺炎)患者的免疫反应障碍是一个反复出现的影响症状和死亡率的问题,但对相关免疫细胞的详细了解 ...
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综述│TRENDS BIOTECHNOL:空间转录组揭示单细胞分辨率下的器官分子结构(国人佳作)
编译:微科盟刘娟,编辑:微科盟景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 生物学和药理学研究的基础是揭示空间尺度的细胞异质性.组织功能和结构.与传统单分子或大数据组学方法不同,尖端的空间转录组学技 ...
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科研│NAT CELL BIOL :单细胞分析揭示不同类型的细胞转录组重塑有助于人类前列腺癌的进展(国人佳作)
编译:微科盟稻和,编辑:微科盟景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 前列腺癌存在显著的临床异质性,表现为空间和克隆基因组的多样性.但相比之下,人们对前列腺肿瘤转录组的异质性了解甚少.在这里, ...
