自己没有测bulk转录组数据难道不会找公共数据吗 / 开普饭

Bulk RNA-seq 和single cell RNA-seq的最主要区别在于单细胞测序代表单个细胞(single cell),而bulk测序代表一群细胞(a population of cell ...

相对于基础实验来说,生信分析已经越来越融入科研工作者的生活中,作为基础实验的验证和辅助手段,帮许多老师省下了很多工作,许多老师已经很熟练的在使用了生信分析这个当下,此次分享,主要是针对还没有熟练生信分 ...

The Journal of Cellular Physiology (JCP)发表了在真核细胞生物学和生理学领域具有高度生物学意义的报告.欢迎对调节真核细胞中细胞周期进程和相变的基因 ...

国际癌症研究机构(IARC)于2021年5月出版了<WHO胸部肿瘤分类(第5版)>.与2015年出版的<WHO胸部肿瘤分类(第4版)>相比,<WHO胸部肿瘤分类(第5版) ...

文章整体研究思路就是利用scRNA数据筛选到了疾病相关干扰素刺激基因及目标细胞群,并探究了其功能通路.再利用bulk RNA数据筛选到疾病相关干扰素刺激基因,且发现富集到与单细胞分析一致的通路.然后通 ...

点击关闭阅读界面 WHO肺部肿瘤组织学分类(第5版,2021) 阳光 Lv.8 2021-5-9 18:00 关注参考WCLC 2020和后续报道资料整理.欢迎学习和分享,存在缺陷和可能的谬误,请各 ...

提到单细胞测序,如果你还是只想到了"太贵"而打算放弃这个科研热点的话,那小编再次提醒你,不要忘了<公共数据库>这一科研利器!用别人的数据,发自己的文章,下面小编就给大家 ...

还给出了一些简单代码,就是看看样本聚类情况,然后留成作业给另外一个学徒,看单细胞R包Seurat的FindAllMarkers函数对7个亚型找到的marker基因,根据传统的bulk转录组差异分析策略 ...

编译:夕夕,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读差异表达分析(DE)和基因富集分析(GSE)常用于单细胞转录组研究中.本研究中,作者开发了一种集成且可扩展的方法--iDEA,可通过分 ...

编译:一个矫情的农民,编辑:Tracy.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读苹果是蔷薇科植物的一员,是世界上温带地区最重要的经济水果作物之一.苹果在成熟过程中伴随着味道.硬度.香气和颜色的巨大变 ...

本文编译自Nature Communications 美国芝加哥大学遗传医学部和人类遗传学系的Yang I. Li等于2019年3月1日在<Nat Commun>上发表题目<Prio ...

免疫治疗已经大大改变的抗肿瘤治疗的格局. 但不可否认的是免疫治疗需要解决的问题还有很多,最急迫的一个就是准确分辨能够从免疫治疗中获益的人群. 对PD-L1.TMB.微卫星不稳定等生物标志物的探索尚不足 ...

导读很多人说我本钱也没有,一件代发也觉得麻烦,还有没有办法通过闲鱼赚钱? 我说还真有,卖数据,当然是公开数据,否则就涉嫌违法了. 很多数据对大部分人而言没有意义,但对一小部分人来讲,可能价值连城,他 ...

了解我的应该都知道我最近几个月都在奋战一个陌生的领域,单细胞转录组数据处理.真的很有挑战性,笔记累积了一大堆了,但是没有太值得分享的,大多是利用bulk转录组数据处理的经验而已,但是下面这个是单细胞转 ...

那个时候写教程,以软件安装,软件input和output为主,因为觉得新手最容易纠结的就是这些了,但是现在回过头来看,软件安装已经成了小菜一碟,对各种bam/sam/vcf/gtf也耳熟能详,所谓的i ...

看了这么多找融合基因的工具,目前只有这个最方便及靠谱,不仅仅是因为它发表于2017年,更重要的是他可以直接基于STAR比对好的bam文件来做分析,而大多数其它软件,需要从fastq文件开始,都不方便. ...

自己没有测bulk转录组数据难道不会找公共数据吗