研究新思路，非肿瘤疾病研究也可，赶紧看过来！ / 开普饭

编译:冬日暖阳,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读前列腺是在雄激素的调节下从胚胎泌尿生殖窦发展而来的器官.除了内胚层来源的上皮细胞,前列腺中还有许多其他类型的具有不同胚胎起源的细胞 ...

Single-cell RNA-seq enables comprehensive tumour and immune cell profiling in primary breast cancer利 ...

导语今天和大家分享的是今年7月份发表在Cancer Immunology, Immunotherapy 杂志(IF=5.442)上的一篇文章,"Integrated analysis of ...

Bulk RNA-seq 和single cell RNA-seq的最主要区别在于单细胞测序代表单个细胞(single cell),而bulk测序代表一群细胞(a population of cell ...

生信实操随着测序技术的进步开发了一种单细胞转录组测序(scRNA-seq)技术,单细胞转录组测序技术可以一次检测成千上万个细胞的转录水平,在单细胞水平上检测和定量基因表达水平变化,从而揭示bulk ...

对应原版教程第5章http://bioconductor.org/books/release/OSCA/overview.html 本小节概述了从测序到数据分析的基本流程,让我们对scRNA-seq先 ...

推荐:江舜尧编译:美少女编辑:马莉美国密西根大学Euisik Yoon等学者于2019年5月15日在期刊 <Nature Communications> 上发表了<Hydr ...

文章信息文献标题:The triumphs and limitations of computational methods for scRNA-seq 发表时间:2020.06.21 发表杂志:N ...

简单介绍下 <ANALYSIS OF SINGLE CELL RNA-SEQ DATA> Orr Ashenberg Dana Silverbush Kirk Gosik 02/25/20 ...

在朋友圈刷到了这个文章,2020年1月4日,中国医学科学院北京协和医学院朱兰及中国科学院北京基因组研究所杨运桂共同通讯在Nature Communications 在线发表题为"Single ...

Integrated analysis of single‑cell RNA‑seq and bulk RNA‑seq unravels tumour heterogeneity plus M2‑li ...

提到单细胞测序,如果你还是只想到了"太贵"而打算放弃这个科研热点的话,那小编再次提醒你,不要忘了<公共数据库>这一科研利器!用别人的数据,发自己的文章,下面小编就给大家 ...

编译:贤,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读肾脏是具有许多不同功能且高度复杂的器官,肾小球和肾小管是肾单位的重要组成部分:这些结构的功能复杂性可能与其不同的细胞类型有关.目前已有研 ...

单细胞转录组下游的降维聚类分群这样的基础操作相信大家应该是都没有问题了,参考前面的例子:人人都能学会的单细胞聚类分群注释 ,只需要你有一个基于基因的表达量矩阵的分析. 对转录组数据(包括单细胞转录组 ...

前面我在<生信菜鸟团>公众号介绍了小鼠的肿瘤免疫微环境推断可以用seq-ImmuCC,本来是想布置作业让大家下载https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproje ...

万字长文细说单细胞文章思路大家好,我是风.欢迎来到风风的从零开始单细胞测序.深度学习应该是目前人工智能最火的领域,李沐老师认为,应当把深度学习当成一门编程语言进行学习,因为本质上深度学习是一种框架, ...

回顾单细胞RNA-seq分析介绍 Bulk vs scRNA-seq Bulk vs scRNA-seq.png Bulk RNA-seq : 它测定的是一个大的细胞群体中的每一个基因的平均表达水平 ...

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