单细胞转录组研究的同时也可以加上传统bulk转录组 / 开普饭

Single-cell RNA-seq enables comprehensive tumour and immune cell profiling in primary breast cancer利 ...

编译:刘娟,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞水平的分子异质性研究技术加深了我们对包括动脉粥样硬化斑块在内的组织中细胞生物多样性的了解.现有的商业化系统能从成千上万个单细胞中 ...

编译:KT!,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞RNA测序技术在过去10年间的先进发展为生物医学研究带来了变革性的影响,使得单细胞转录组的分析获得了前所未有的分辨度和通量.单 ...

病毒工具使神经生物学家可以方便地实现细胞特异性地环路追踪和操控. 最近,艾伦脑科学研究所的Bosiljka Tasic团队在 Neuron 杂志在线发表了题为"Enhancer viruse ...

编译:Echo,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读纤维化是各种因素(生物因素.化学因素.物理因素等)损伤作用下导致细胞外基质的异常合成增加和(或)降解不足所引起的病理过程,是全球医 ...

编译:罗睺,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞RNA测序(scRNA-seq)是研究脑和中枢神经系统(CNS)中单个细胞转录组的一种有前途的方法.这项技术充当了神经科学,计算 ...

编译:贤,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读肾脏是具有许多不同功能且高度复杂的器官,肾小球和肾小管是肾单位的重要组成部分:这些结构的功能复杂性可能与其不同的细胞类型有关.目前已有研 ...

编译:卡德加,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读植物功能是单个细胞在不同组织中协同作用的结果.RNA-seq测序技术和组织处理技术的进步使研究者能够捕获单细胞分辨率下的转录变化.单 ...

An atlas of the aging lung mapped by single cell transcriptomics and deep tissue proteomics 联合单细胞转录组 ...

还给出了一些简单代码,就是看看样本聚类情况,然后留成作业给另外一个学徒,看单细胞R包Seurat的FindAllMarkers函数对7个亚型找到的marker基因,根据传统的bulk转录组差异分析策略 ...

编译:寒江雪,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在拟南芥中,受精卵经历不对称的细胞分裂形成了原胚的两种不同的细胞类型,顶端细胞和基底细胞.调控顶端细胞(AC)和基底细胞(BC)发育 ...

当你的才华还撑不起你的野心时,请潜下心来,脚踏实地,跟着我们慢慢进步.不知不觉在单细胞转录组领域做知识分析也快两年了,通过文献速递这个栏目很幸运聚集了一些小伙伴携手共进,一起成长. 文献速递栏目通过简 ...

前两日双星陨落,我国一天痛失两位院士.一位是让中国人吃饱的"杂交水稻之父"袁隆平,一位是"中国肝胆外科之父"吴孟超.吴老曾以1960年至1977年间切除治疗原发 ...

编译:Yong-qin,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读黄酮类化合物是植物体内重要的多酚类化合物,可分为三类:花青素.原花青素(PAs).黄酮醇.原花青素,又称缩合单宁,是由儿茶 ...

编译:云佩b,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读无花果为桑科落叶果树,富含花青素等有益于人体的成分.但关于花青素的分子结构信息较少.本研究采用了黄色阶段与红色阶段的无花果皮作为转录 ...

编译:雪源,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读疫苗是医学领域最伟大的成就之一,它大大降低了人类许多重大传染病的死亡率和发病率.然而对疫苗介导的保护机制的理解仍然不完善.新兴的系统 ...

编译:卡德加,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读硅藻是海洋初级生产和碳循环的重要参与者,然而其对于温度变化的调节适应机制仍知之甚少.在本研究中,研究者分别对具有耐冷和耐热特性的两 ...

这份软件清单,能看出作者的确是花了大力气的,满满的都是诚意. 主要涵盖了转录组分析的以下18个方向,看我我才明白自己的水平的确没到家,印象中的转录组分析也就是差异表达,然后注释一下,最多分析一下融合基 ...

单细胞转录组研究的同时也可以加上传统bulk转录组