单细胞RNA-seq的设计和方法(一)
相关推荐
-
科研 | Circulation:单细胞转录组--心脏研究领域的新发现
编译:杨峰,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 心肌肥厚有时会作为对压力超负荷.容积超负荷或梗死后重塑引起的左心室(LV)壁应力增加的代偿反应出现.然而,在长期的疾病应激诱导的心肌 ...
-
生信实操丨带你复现单细胞转录组纯分析文章(一)
生信实操 随着测序技术的进步开发了一种单细胞转录组测序(scRNA-seq)技术,单细胞转录组测序技术可以一次检测成千上万个细胞的转录水平,在单细胞水平上检测和定量基因表达水平变化,从而揭示bulk ...
-
PBJ|广东省农业科学院茶叶所洪彦彬实验室利用单细胞RNA-seq描述了异源四倍体花生叶片中转录组的分布并鉴定了关键的转录因子
单细胞 RNA-seq (scRNA-seq)作为描述人类细胞转录组的有力工具已经受到重视,但该技术在植物细胞中的应用还不广泛.在此,我们描述了在花生叶原生质体细胞分离系统的成功发展.根据已报道的标记 ...
-
科研 | Genome Biology | 英国威康桑格研究所:scRNA-seq评估冷藏后人肺、脾和食道组织的稳定性
编译:不二,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 背景:人体细胞图谱是一项大型的国际合作项目,旨在绘制人体所有细胞类型.单细胞RNA测序可以生成高质量的数据,绘制此类图谱.但是,新鲜样 ...
-
综述│TRENDS BIOTECHNOL:空间转录组揭示单细胞分辨率下的器官分子结构(国人佳作)
编译:微科盟刘娟,编辑:微科盟景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 生物学和药理学研究的基础是揭示空间尺度的细胞异质性.组织功能和结构.与传统单分子或大数据组学方法不同,尖端的空间转录组学技 ...
-
人为什么会“人老珠黄”?《Cell》:解码人类皮肤衰老机制
中国科学院动物研究所及中国科学院北京基因研究所的专家们,揭开了皮肤衰老过程中细胞类型特异性转录网络的变化,并首次绘制出了人类皮肤衰老的单细胞转录组图谱. 衰老,是人类的自然进程. 随着年龄增长,人体的 ...
-
干货:“战略薪酬”设计的方法
薪酬调整,或薪酬体系优化,可能会有若干原因,如: (1)薪酬的标准水平低. (2)结构不合理. (3)体系不明晰. (4)运行不顺畅. -- 比较重要的一个原因就是,当企业战略进行调整时,相应的管理体 ...
-
科研 | CELL REP:人冠状病毒侵入因子的单细胞RNA表达图谱
编译:不二,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 为了预测人类冠状病毒的生物取向性,研究人员利用单细胞转录组学分析了28种SARS-CoV-2和冠状病毒相关受体因子(SCARF).SC ...
-
科研 |NAT COMMUN:单细胞RNA测序鉴定通过双电位中间产物形成的早期感觉神经元的多样性
编译:胡胡,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 躯体感觉是由多种初级感觉神经元的存在定义的,这些神经元具有独特的生物学特征以及对外部和内部刺激的反应特征.然而,关于细胞状态的多样性是 ...
-
科研 |Cancer Cell:单细胞RNA序列揭示小儿室管膜瘤的细胞层次结构和受损的发育轨迹
编译:小北,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 室管膜瘤是一种异质性并具有成熟分子群的中枢神经系统肿瘤.在本研究中,研究者利用单细胞RNA-seq分析了不同分子组成和解剖位置的室管膜 ...
-
科研 | Cell:单细胞RNA测序揭示治疗诱导的人类肺癌进化
编译:阿温,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 肺癌是导致癌症患者死亡的主要原因,它表现出的异质性使其具有适应性,限制了治疗的成功,且仍没有被完全了解.本研究采用30名转移性肺癌患者 ...
-
科研| Molecular plant:利用单细胞RNA测序研究气孔谱系细胞发育的分子动态
编译:夕夕,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 气孔谱系细胞发育的调控已被广泛研究.然而,基于单细胞转录组研究这一生物学过程还尚未报道.本文,作者主要对拟南芥5日龄的12844个单 ...
-
科研 | Nature Communications:单细胞RNA序列揭示复发性胶质母细胞瘤的一般神经发育层次
编译:怀瑾,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 癌症干细胞对于癌症的发生.发展和耐药性至关重要,但目前对于这些过程及其与胶质母细胞瘤异质性相关性的理解有限.因此,本研究对成年胶质母 ...
-
科研 | Gut:通过单细胞RNA测序分析原发性胃腺癌的转录异质性(国人佳作)
编译:小北,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 目的:肿瘤的异质性是胃腺癌(GA)准确诊断和治疗的主要障碍.研究者在GA中利用单细胞RNA测序报道了系统的转录图谱来解释分子和细胞内的 ...
-
科研 | Cell Discovery:单细胞RNA测序揭示了人类肝脏免疫细胞的异质性(国人作品)
编译:小北,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 肝脏在机体免疫防御和免疫耐受中发挥重要作用.肝脏上的免疫细胞(LrICs)决定免疫特性,但是这些细胞独特的组成和异质性尚未完全掌握.本 ...