综述 | npj Biofilms and Microbiomes：微生物成分分析：标准化和差异丰度分析 / 开普饭

对宏基因组测序后的数据进行抗生素耐药性基因组的注释与分析,逐渐成为一条必经之路.过去,人们需要自己下载相关数据库再用比对工具进行比对,然后去冗余,再进行下游分析.这通常需要学习编程并熟练应用,对于一些 ...

导读病毒(T4型噬菌体)在土壤有机质矿化中的潜在作用研究获进展等5则进展. 来源:根据中国科学院.南京土壤研究所近期相关报道和作者供稿整理. 病毒(T4型噬菌体)在土壤有机质矿化中的潜在作 ...

目前细菌群落研究常用的技术是16S相对定量扩增子测序,而最近越来越多的研究者开始采用绝对丰度(即菌群的实际数量)对细菌群落进行绝对定量研究,今天小编就微生物绝对定量研究的一些常见问题在此总结一下. 问 ...

QIIME 2用户文档. 8差异丰度分析gneiss Differential abundance analysis with gneiss 原文地址:https://docs.qiime2.org/ ...

编译:Jione.song,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读人类肠道菌群在健康和疾病中的作用越来越受到人们的关注,营养不良(肠道微生物组的紊乱)已通过"微生物组-肠- ...

编译:萌依依,编辑:木木夕.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读阐明肠道微生物群生态演替的机制是肠道生态学的中心主题.在斑马鱼孵化和饲养环境的实验操作下,我们验证了我们的核心假设,即由于宿主遗传 ...

为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...

编译:李飞,编辑:Tracy.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读各种生物和非生物因素的影响会引起植物转录组和代谢组的变化,导致根和叶分泌物改变,进而改变植物共生微生物组落.研究表明,由环境影响 ...

编译:依然,编辑:Tracy.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读检查点封锁的癌症免疫疗法已经成为许多癌症类型的标准护理治疗,尽管如此,仍然缺乏强有力的生物标记预测物.最佳宿主微生物群还没有被具 ...

编译:笑笑,编辑:谢衣.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读植物在生长发育过程中会受到各种各样的生物和非生物胁迫,诱导其转录组学和代谢组学的变化,导致根和叶片渗出物的变化,进而影响与植物相关的微 ...

编译:胜寒,编辑:谢衣.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读大量基因组学研究已经揭示了肠道菌群组成和宿主代谢之间的联系.研究结果认为微生物群落与代谢性疾病之间可能存在因果关系,并显示出代谢性疾病 ...

2021年3月美国德克萨斯大学奥斯汀分校营养科学系Molly S. Bray于Cell Metabolism发表综述文章Circadian rhythms and the gut microbiome ...

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