单细胞时代 || 网络分析应用进展，机遇与挑战 / 开普饭

北京讯细胞命运或状态由多维度染色质修饰景图及其调控基因表达谱决定.虽然各类组蛋白修饰.转录因子结合等表观因子调控的机制与结果各异,却协同决定了基因的选择性表达.全局性的研究多维度的表观因子相 ...

编译:夕夕,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读差异表达分析(DE)和基因富集分析(GSE)常用于单细胞转录组研究中.本研究中,作者开发了一种集成且可扩展的方法--iDEA,可通过分 ...

编译:卡德加,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读植物功能是单个细胞在不同组织中协同作用的结果.RNA-seq测序技术和组织处理技术的进步使研究者能够捕获单细胞分辨率下的转录变化.单 ...

文献解读 Potter, S. S. (2018).Single-cell RNA sequencing for the study of development, physiology anddis ...

编译:艾奥里亚,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读近年来,随着单细胞RNA测序方法的规模和能力迅速扩大,这使得重大发现和大规模细胞测绘工作成为可能.但这些方法还没有得到系统和全面的 ...

浩瀚星空吸引着人们进行探索.在转录组学中,空间分辨率也开辟了新的世界. 导读空间转录组学是单细胞分析后的下一波热潮,这是一个非常活跃的领域,新的技术开辟了新的科研角度.该技术不仅可以获取转录组数据并 ...

编译:艾奥里亚,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读洛桑联邦理工大学[École Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL)]的Gioele ...

单细胞转录组学(sc-RNAseq)研究,可以更加有效的解释组织的异质性,从单个细胞分辨率来解释更多bulk水平上难以解释的生物学问题.已经广泛用于肿瘤异质性.细胞发育.免疫微环境等课题研究.其产生的 ...

编译:罗睺,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞RNA测序(scRNA-seq)是研究脑和中枢神经系统(CNS)中单个细胞转录组的一种有前途的方法.这项技术充当了神经科学,计算 ...

编译:夕夕,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读空间分辨转录组学的最新进展极大地扩展了复杂的多细胞生物系统的知识.近年来,该领域迅速扩展,并且已经开发了几种旨在将基因表达数据与空间信 ...

编译:刘娟,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞水平的分子异质性研究技术加深了我们对包括动脉粥样硬化斑块在内的组织中细胞生物多样性的了解.现有的商业化系统能从成千上万个单细胞中 ...

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