单细胞转录组学生物标志物和靶点挖掘的新方法 / 开普饭

编译:思越,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读转移性结直肠癌的免疫治疗仅对具有高微卫星不稳定性的错配修复缺陷肿瘤有效,并表现出免疫浸润,这表明肿瘤细胞可以决定其免疫微环境.为了理解 ...

编译:夕夕,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在过去的几十年中,研究人员对肠道功能和病理生理学的理解有了很大的进步,而先进的技术使研究人员加深了对肠道功能和病理生理的了解. 单细 ...

Highlights 单细胞RNA-seq分析说明了在人类和小鼠的结直肠癌中存在保守的骨髓细胞子集. 两个完全不同的巨噬细胞各自显示了炎症和生成血管特性. 两个不同的巨噬细胞对CSF1R blocka ...

做单细胞数据分析,我们当然希望看到一个清晰的降维聚类分群结果,这样才方便做生物学亚群注释,比如前面的例子:人人都能学会的单细胞聚类分群注释 ,第一次分群就非常漂亮! 但那个毕竟是理想情况下,实际上很 ...

最近看到文章里面出现了单细胞转录组测序的tSNE图,如下: 看到如此巨大的细胞数量,本来以为是10X,结果仔细看文章,作者利用CyTOF技术对HCC的免疫微环境异质性进行了分析,约四百万个免疫细胞呈现 ...

在单细胞水平探究肝癌免疫微环境研究最早而且出名的就是北大张泽明教授团队发表在Cell. 2017 Jun 的文章:Landscape of Infiltrating T Cells in Liver ...

免疫检查点阻断(ICB)可以破坏肿瘤细胞的免疫逃逸而广泛用于肿瘤免疫治疗,但是其只在特定肿瘤的一小部分人群中有作用,因此,有人提出了其他免疫治疗策略,包括清除免疫微环境中的促肿瘤生成细胞和免疫抑制性细 ...

在教程 CNS图表复现08-肿瘤单细胞数据第一次分群通用规则,这个第一次分群规则是 : immune (CD45+,PTPRC), epithelial/cancer (EpCAM+,EPCAM), ...

编译:逍遥君,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读垂体前叶在调节各种生理过程(包括机体生长.生殖.代谢和应激反应)中起核心作用.本研究对来自人胎儿垂体的4113个单个细胞进行单细胞R ...

编译:小北,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读目的:链脲佐菌素(STZ)模型广泛应用于糖尿病研究.然而对这个模型中胰腺内分泌细胞和分子状态尚不清楚.本研究对胰岛细胞经STZ处理后的 ...

编译:思越,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读鼻咽癌(NPC)是一种侵袭性恶性肿瘤,种族和地理分布极为不均.鼻咽癌中存在非常复杂的肿瘤微环境(TME),靶向TME在NPC中标志着 ...

编译:CCI,编辑:十九.江舜尧. 本微文由作者原创编译,欢迎转发转载. 浙江大学药学院范骁辉教授课题组于2020年5月21日在知名学术期刊Protein & Cell发表题目为<New ...

编译:夕夕,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞转录组学为推断细胞网络中配体受体(LR)的相互作用提供了前所未有的机会.本文介绍了一种新的LR数据库和一种新的正规化评分来执行这 ...

编译:Nicole,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读上皮组织的维持是由干细胞驱动的,但是目前在单细胞水平的转录异质性了解非常有限.表皮基底细胞维持皮肤组织并促进伤口愈合,之前的研 ...

编译:小鹿同学,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 骨髓衍生抑制细胞(MDSCs)是先天性免疫细胞,具有抑制癌症期间适应性免疫反应的能力.目前尚不清楚MDSCs与正常髓样对应物有何区别,这 ...

编译:艾奥里亚,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读抗体记忆可以保护人类免受多种疾病的侵袭.保护性抗体记忆响应需要激活转录程序.细胞增殖以及产生抗原特异性的抗体,但有关这些响应之间是 ...

编译:夕夕,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞转录组学产生了越来越多的数据,其中包含多达数百万个细胞中数千个基因的RNA表达水平.常见的数据分析管道包括降维步骤,用于以二维方 ...

单细胞转录组学生物标志物和靶点挖掘的新方法