学徒笔记——芯片数据的注释文件获取 / 开普饭

#AnnoProbe包安装 install.packages('devtools') library(devtools) install_github("jmzeng1314/AnnoPro ...

需要纯净代码时,就想删除所有注释,一个一个文件挨着找的话,实在是手酸打开 VScode ( Visual Studio Code) 编辑器按住 CTRL + SHIFT + F 键,全局搜索 ...

欢迎来到医科研,这里是白介素2的读书笔记,跟我一起聊临床与科研的故事, 生物医学数据挖掘,R语言,TCGA.GEO数据挖掘. 这一节的内容包括应用 GEOquery包下载芯片数据,提取表达矩阵,提取m ...

编者寄语:长非编码RNA(LncRNA)是一类长度大于 200 个核苷酸的非编码 RNA的总称.因其有着非常重要的调控功能,且几乎参与到了各种生物学过程和通路,一直是肿瘤等各类疾病研究中的" ...

最近jimmy老师在学徒群了扔了一个数据挖掘文献图表复现任务,作为老师的新晋小透明学徒,希望可以表现一下,在分析数据集GSE62133时,并没有其平台GPL14951相应的注释包,把这个探索过程分享一 ...

前面我在<生信技能树>的教程:什么,你感兴趣的GEO数据集没有关联到原始文献出处,提到了一个GSE数据集是可以关联到很多文献,如果这个数据集被挖掘过.但是举例子的时候留空白了,居然被眼尖的 ...

写在前面我们在处理GEO芯片数据的时候,经常会碰到芯片的数据的注释文件没有提供基因名,只有基因的序列.替代的解决办法就是对所有的注释数据来进行批量的blast,利用注释文件提供的序列来通过blast ...

<空天防务观察>之问:恩格斯认为:"军队组织结构的发展完善,首先同社会生产的发展和兵器的不断改进有关.由于工业的发展带动兵器和作战方法的改进,促进了军队组织结构的不断完善&quo ...

一.5月14日热点前瞻热点一:国产芯片逻辑概述:13日晚中芯国际发布一季度财务数据,营收同比增长35.3%,创历史新高.公司决定将2020年资本开支进一步上调至43亿美元,以充分满足市场需求. 相 ...

Sub 遍历指定文件夹下的所有文件名() Dim sr As FileSearch '定义一个文件搜索对象 Set sr = Application.FileSearch sr.LookIn = 'E ...

随着智能手机更新迭代步伐的加快,尤其是5G时代到来引发的换机潮,越来越多的二手旧手机将回收并再次流入市场销售.央视新闻近日提到一个我们生活中非常容易忽视的问题--二手旧手机原机主的信息安全.报道称,商 ...

Excel利用Excel数据批量新建文件夹

学徒笔记——芯片数据的注释文件获取