GEO的数据注释文件没有基因名肿么破？ / 开普饭

我前面写到了生信分析人员如何入门linux和perl,后面还会写R和python的总结,但是在这中间我想插入一个脚本实战指南.其实在我前两篇日志里面也重点提到了学习编程语言最重要的就是实战了,也点出了 ...

biopython和bioperl, biojava项目类似,都是Open Bioinformatics Foundation组织的项目之一,旨在提供一个编程接口,方便生物信息数据的处理.OBF的成员 ...

为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...

欢迎对生物信息学科学习感兴趣而不仅仅是对生物信息应用感兴趣的朋友加到我们QQ交流群(276151571) "bioinformatic*中国" 作为被某群群管(非上述推荐群)视为破 ...

第一讲 - 主题 - <TBtools-生信数据下游利用小外挂> TBtools例图展示 ......由于这个太多...所以不展示.... bioinformtaics*中国 Semina ...

编译:阿昊,编辑:Emma.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读锦葵科含有许多重要的经济植物,包括棉花.可可和榴莲.近年来,研究人员已经对几种锦葵科植物的基因组进行了破译,并为单个物种生成了许多 ...

写在前面高通量测序技术的普及,带来的是遍地的基因组.昨日,OneKP项目又发了一个Paper[因为很久以前他们就发过,数据也早就可以获取].他们再发多少paper,事实上,我并没有太多感触,因为On ...

选择在GEO官网的GPL平台下载 : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GPL21827 rm(list = ls()) ## 魔 ...

SPSS数据文件的扩展名是: ( C ) A. .sps B. .spss C. .sav D. .sas

基因组区间文件一般是拷贝数变异记录文件或者peaks文件,一般的注释是基于基因的,因为目前大家对编码蛋白的基因是比较熟悉的,一个区域跟基因关联起来了就大概了解它的功能了. 首先得到需要注释的bed文件 ...

高通量数据下载还能这样操作? 谁能告诉我,这数据测毁了么? 目的: 在UCSC下载hg19参考基因组,我博客有详细说明,从gencode数据库下载基因注释文件,并且用IGV去查看你感兴趣的基因的结构, ...

最近jimmy老师在学徒群了扔了一个数据挖掘文献图表复现任务,作为老师的新晋小透明学徒,希望可以表现一下,在分析数据集GSE62133时,并没有其平台GPL14951相应的注释包,把这个探索过程分享一 ...

我们有很多学徒数据挖掘任务,已经完成的目录见:学徒数据挖掘专题半年目录汇总(生信菜鸟团周一见) 欢迎大家加入我们的学习团队,下面看FPKM文件后该怎么下游分析文献标题是:Oncogenic lncR ...

大部分的生物学高通量数据处理后都是得到基因集,不管是上调下调表达基因集,还是共表达的模块基因集,都是需要注释到生物学功能数据库来看基因集的意义,最常见的是GO/KEGG数据库啦,还有很多其它在Msig ...

有一些五六年前的学生们都成长为了各个生物信息学相关公司的小领导,而且他们都有了自己的公众号,知乎号,也算是一番人物.最近他们跟我反馈面试找不到或者说很难直接考核筛选到认真干活的生信工程师,挺有意思的. ...

目前芯片数据的分析流程都可以通过AnnoProbe包简单的完成上游分析,包括表达矩阵获取.分组方案的构建和数据注释,但是也存在一些平台的数据无法被该包直接获取.AnnoProbe获取注释信息的方式是通 ...

GEO的数据注释文件没有基因名肿么破？