使用多个网页工具预测MiRNA–mRNA相互作用 / 开普饭

"胡,starbase是干嘛的?" "不就是预测miRNA与mRNA结合的数据库嘛." "还有呢?" "......" ...

好啦,小伙伴们,上次咱们刚介绍过神器starbase,那么今天咱们再来学习一下另一款神器:miRWalk(http://mirwalk.umm.uni-heidelberg.de/).在咱们预测的时候 ...

本篇我们将介绍miRNA与mRNA结合预测.LncRNA与miRNA结合预测.LncRNA与蛋白RNP结合预测相关内容一.miRNA与mRNA结合预测 miRNA是非编码调控小分子,通过抑制基因表达 ...

从miRNA出发,预测其调控的靶基因,另外是从靶基因出发,预测能调控该靶基因的miRNA,即双向预测.其中基因的编号支持Gene symbols ,EntreIDs和 Ensemlb-IDs.操作也是 ...

编译:伊安,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读硼替佐米是一种抑制26S蛋白酶体降解泛素化蛋白的抗肿瘤药物.虽然有研究认为硼替佐米激活凋亡相关的转录调控,但其对非编码RNA介导的转录 ...

前面,我们多次介绍了关于miRNA的靶向基因的查询工具,分别是: microRNAs靶基因数据库哪家强使用miRNAtap数据源提取miRNA的预测靶基因结果对miRNA进行go和kegg等功能数 ...

此前,少数派曾为你介绍过 8 款在线图片处理工具,让你仅需打开浏览器前往特定的网页就能进行图片处理,而无需安装动辄几百 MB 的复杂软件,以及付出相对的时间和上手成本,实现即开即用.用完即走. 本文将 ...

朋友圈经常就被刷一个生存分析的教程,感觉都成月经帖了!关键是也没有讲什么新颖的东西,无非就是某个新的网页工具的用法,实在是太low了.必须得从我这里结束它们~ 很久以前我们这个公众号推出过一个生存分析 ...

一直都知道自己不擅长写代码,也实在是没有学过或者刻意锻炼过软件项目开发相关知识.但是对生物信息学来说,这些都是低频需求,除非是疯狂的热爱,一般我不会建议大家过多的关注这些`奇淫巧技`,而应该专注于科学 ...

看到一篇文章提到了这个分析,作者下载了TCGA数据库的OV的Affymetrix HT HG-U133A arrays, n = 598表达矩阵和Agilent 8 × 15 K Human miRN ...

看自己感兴趣的基因在自己研究的癌症的预后相关性是高频需求,其实就是拿到基因在癌症病人的表达信息,然后就可以根据表达量高低对病人进行分组,最后这个分组是否统计学显著的把病人的生存情况区分开来. 但是我没 ...

写在前面无意中逛群主GitHub看到一个好玩的项目,就试着走了一波,有惊无险的跟了下来,中间还被我火眼金睛挑出来了3个bugs反馈给他! 原本以为就是一步步跟着说明书来搭建一个自己的网页工具.没曾想 ...

RNA-seq数据的下游分析网页工具不要太多,这里介绍一个最新的: Sundararajan Z, Knoll R, Hombach P, et al. Shiny-Seq: advanced gui ...

使用多个网页工具预测MiRNA–mRNA相互作用