10X genomics单细胞数据集探索 / 开普饭

本文由Bayegy根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读明明测了100000条序列,为什么我用dada2得到的OTU丰度只有8000?是人性的扭曲还是道德的沦丧? ...

简介目前10X单细胞测序算是测序行业最热门的方向之一,它可以在低测序深度的情况下一次性的获得成千上万的细胞及其每个细胞内的基因表达情况,对了解细胞异质性和新的细胞类型非常有利.官网介绍的功能和优势如下 ...

In a mysterious addition to the brain's family of cells, researchers have discovered a new kind of n ...

Cell Ranger是一个10X genomics公司的单细胞分析软件,将原始的fastq文件生成后续分析的feature-barcode表达矩阵.其中包括很多模块,本次主要介绍cellranger ...

男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树, 一枚大型测序工厂的螺丝钉, 一个随机森林中提灯觅食的津门旅客. 我们生活着的世界并非只有我们自己,而是有很多小于或 ...

当你的才华还撑不起你的野心时,请潜下心来,脚踏实地,跟着我们慢慢进步.不知不觉在单细胞转录组领域做知识分析也快两年了,通过文献速递这个栏目很幸运聚集了一些小伙伴携手共进,一起成长. 文献速递栏目通过简 ...

雷帝网雷建平 9月14日报道美国单细胞测序公司10x Genomics昨日在美国纳斯达克上市,股票代码为"TXG". 10x Genomics最初的发行区间为31到35美元,之 ...

10x Genomics, Inc.(Nasdaq: TXG,以下简称:10x Genomics)宣布以 3.5 亿美元的现金和股票价格收购 ReadCoor, Inc(以下简称:ReadCoor). ...

中国最早的医学典籍<黄帝内经>早在两千多年前就指出:圣人不治已病治未病.不过,早期发现癌症的主要障碍之一是我们对肿瘤启动事件了解不足.历来,癌症研究一直集中于已发生肿瘤的组织学和分子学特征 ...

写在前面你现在看到的是文献俱乐部2019年笔记分享第一弹,我将会在春节7天连续分享,目录如下: 2019年1月份第1周(总第49周)单细胞转录组探索CAFs的功能和空间异质性 2019年1月份第2周 ...

栏目起源逆向收费读文献社群 (2018-01-07) 逆向收费读文献社群 (2018-06-09) 逆向收费读文献社群(第二年通知)(2019-01-26) 大概有50人加入吧,成功坚持下来的朋友们 ...

众所周知,测序数据单端测序就是一个fq文件,双端测序就2个.但是呢,10X的单细胞转录组原始数据的话, 比较特殊,它的测序文库中包括index.barcode.UMI和测序reads. 首先,1-26 ...

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