单细胞工具箱|Cell Ranger-V6.0 开启单细胞之旅（上） / 开普饭

谷歌邮箱推送给我了关键词订阅文献,单细胞的,我看到如下所示: 下意识的以为是有人把单细胞数据分析流程总结成为了一个地铁线路图或者公交车线路图,因为我们生信技能树VIP群里这两天有人把一下NGS分析 ...

看到2020年2月发表在nature cancer这个新杂志的文章<Single-cell analyses reveal increased intratumoral heterogeneit ...

是时候把生信技能树的舞台交给后辈! 粉丝来稿作者:黑川五郎写在前面单细胞转录组以10X公司为主流,单细胞天地公众号详细介绍了cellranger流程,大家可以自行前往学习,如下: 单细胞实战(一 ...

我所理解的cellranger软件理想原始输入数据就是SRA格式,然后利用sra-tools分为read.barcode+UMI.index三个fastq.gz文件.最后直接利用cellranger即 ...

不知不觉cellranger已经更新到6.0了.前面已经介绍了4.5,今天介绍下6.0 cellranger更新到4啦(全新使用教程) cellranger更新到5啦(全新使用教程) CellRang ...

当你的才华还撑不起你的野心时,请潜下心来,脚踏实地,跟着我们慢慢进步.不知不觉在单细胞转录组领域做知识分析也快两年了,通过文献速递这个栏目很幸运聚集了一些小伙伴携手共进,一起成长. 文献速递栏目通过简 ...

前些天我发布了 cellranger更新到4啦,提到了可以免费做一下10X的单细胞转录组数据上游分析,反正刚刚购买的服务器闲着也是闲着.其中一个项目是12个样品的10X的样本的fastq测序原始数据, ...

冷知识:其实一个10X单细胞转录组样品可以有多达84个fastq文件哦! 我们在单细胞天地多次分享过cellranger流程的笔记,大家可以自行前往学习,如下: 单细胞实战(一)数据下载单细胞实战( ...

看到了一个预印本研究成果,标题很霸气:<Cell atlas of human uterus>,Posted February 19, 2018. 链接是https://www.biorx ...

书籍翻译好的书籍是人类进步的阶梯,但有些人却找不到优秀的阶梯,为此我们开设了书籍翻译这个栏目,作为你学习之路的指路明灯:分享国内外优秀书籍,弘扬分享精神,做一个知识的传播者. 希望大家能有所收获! ...

为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...

简介目前10X单细胞测序算是测序行业最热门的方向之一,它可以在低测序深度的情况下一次性的获得成千上万的细胞及其每个细胞内的基因表达情况,对了解细胞异质性和新的细胞类型非常有利.官网介绍的功能和优势如下 ...

导语今天和大家分享的是2020年1月份发表在SCIENTIFIC DATA杂志上的一篇文章(IF=5.929)"Single-cell RNA sequencing of human ki ...

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