scRNA-seq表达矩阵的构建 / 开普饭

编译:刘娟,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞水平的分子异质性研究技术加深了我们对包括动脉粥样硬化斑块在内的组织中细胞生物多样性的了解.现有的商业化系统能从成千上万个单细胞中 ...

RNA测序(RNA-seq)已成为差异基因表达和mRNA差异剪接的转录组范围分析不可或缺的工具.JingleBells将单细胞数据划分为免疫和非免疫类,共收录120篇免疫相关以及182篇非免疫的单细胞 ...

编译:卡德加,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读植物功能是单个细胞在不同组织中协同作用的结果.RNA-seq测序技术和组织处理技术的进步使研究者能够捕获单细胞分辨率下的转录变化.单 ...

编译:罗睺,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞RNA测序(scRNA-seq)是研究脑和中枢神经系统(CNS)中单个细胞转录组的一种有前途的方法.这项技术充当了神经科学,计算 ...

编译:微科盟刘娟,编辑:微科盟景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读生物学和药理学研究的基础是揭示空间尺度的细胞异质性.组织功能和结构.与传统单分子或大数据组学方法不同,尖端的空间转录组学技 ...

上个月我们组建了:<单细胞CNS图表复现交流群>,见:你要的rmarkdown文献图表复现全套代码来了(单细胞),也分享了单细胞转录组数据分析的流程: 祖传的单个10x样本的seurat标 ...

基因过表达小鼠,是指将目的DNA片段构建到过表达载体中,然后通过受精卵的原核注射,将其整合到小鼠的基因组DNA上,从而实现该DNA片段的过量表达的实验过程. 依据实验目标和转入DNA片段的不同,主要可 ...

LentiCRISPRv2-GOI过表达载体构建利用同源重组的方法构建LentiCRISPRv2-GOI过表达载体,采用双酶切的方式获得线性化载体,根据同源重组设计目的片段的引物.目的片段的获得分为 ...

与小鼠相比,大鼠体型较大,其生理学特征易于研究,是多种人类疾病的重要模式动物. 大鼠是研究生理学的理想模型,研究者已经得到了大量的纯系大鼠,并且在大鼠的行为.细胞.生理.生化.药理和毒理学方面积累了大 ...

貌代码被折叠了,大家需要阅读原文才能复制粘贴我代码在Rstudio里面直接运行,几分钟就可以学会15个图的制作! basic visualization for expression matrix j ...

响应生信技能树的号召:lncRNA数据分析传送门 , 一起来一个lncRNA数据分析实战! SRA->FASTQ->BAM->COUNTS 这几个步骤而已,中间穿插一些质控的手段,每 ...

在第一讲我们详细介绍了GEO数据库的基础知识及规律,也了解了如何利用官方R包GEOquery来探索GEO数据库,当然,我的生信菜鸟团博客里面也从很多其它角度解析过它,欢迎大家自行搜索学习.总得来说,从 ...

发表这个算法的文章是:Clinical drug response can be predicted using baseline gene expression levels and in vitr ...

最近生信技能树的很多朋友反馈一个GEOquery的bug,而且这个错误对初学者来说,是不可能解决的问题,值得分享一下!(2018-11-27 计) 就是昨天推文末尾的小测试: GEOquery包的ge ...

scRNA-seq表达矩阵的构建