IGV-sRNA - 植物小RNA测序数据专用基因组浏览器 / 开普饭

编译:阿菲,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在过去的十年里,由于测序成本的持续下降和最新的易于使用的文库构建工具的开发,RNA测序(RNA-seq)已经超过微阵列成为基因表达谱 ...

编译:晨晨,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读植物基因组编码区有很强的保护,不同植物物种的根的结构差异很大,相同物种不同的生态型之间也存在差异.不同生态型植株的非编码RNA进化迅速 ...

前面我们特意用scalpel软件来找indel,期待它会有一些出彩的表现,当然我还没来得及比较它找到的INDEL跟GATK等工具区别在哪里,不过我们先在IGV里面看看找出来的是什么吧. [直播]我的基 ...

编译:夕夕,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读目的:系统红斑狼疮是(SLE)是一种异质性自身免疫性疾病,治疗困难.目前SLE患者没有最佳分类.因此,患者对于现有治疗反映是不可预测的 ...

小RNA是指一类高度保守的长度为18-32nt的RNA分子,主要包括miRNA.siRNA.snoRNA和piRNA等,是生命活动重要的调控因子,在基因表达调控.生物个体发育.代谢及疾病的发生等生理过 ...

miRNA,特别是在人体液中发现的那些,已经被建议作为潜在的生物标志物.在各种体液中,脑脊液(CSF)有希望作为神经疾病的诊断和监测的分析目标.然而,相关的基因组规模研究是有限的,目前没有脑脊液中外泌 ...

编译:夕夕,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读西瓜是一种重要的蔬菜作物,在美国已被广泛种植,全球产量约为1亿吨.白粉病菌引起的白粉病(PM)是西瓜主要生产限制因素.美国农业部在南卡 ...

由加州大学里弗赛德分校的生物医学科学家领导的团队开发了一种新的RNA测序方法"通过克服RNA修饰终止测序的全景RNA显示"或PANDORA-seq-可帮助发现许多修饰的小分子以前无 ...

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我目前的项目主要参考了一篇文献,我想借重复这篇文章的数据分析及表格制作来巩固学习3天的生信技能树培训内容.我翻到文章最后找到了数据的获取方式: 载入下载页面后一看有两个"数据大小" ...

我在B站有一个microRNA测序数据分析实战演练,主要是从ebi下载,项目号是Project: PRJNA486534,共11个小RNA建库测序后样本的数据分析.但还是得找其它练习题给大家作为课程配 ...

写在前面伴随高通量测序技术的普及,海量的测序数据被产生并上传到网络数据库,如NCBI SRA.我们每个人都可以很轻易地获得这些数据,并用于有生物学问题针对性地分析.数据容易获取,但数据具体来源和信息 ...

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