使用Mutant-allele tumor heterogeneity(MATH)算法评估肿瘤异质性 / 开普饭

肺癌丨精准医疗,免疫治疗生物标志物,超进展以及假性进展继PD-L1之后,基于组织检测的肿瘤突变负荷(tTMB)逐步成为预测免疫检查点治疗疗效的潜在标志物.目前也有研究探索了血液肿瘤突变负荷(bTMB ...

肝细胞癌(HCC)是一种原发于肝脏的恶性肿瘤,高居全球癌症死亡率的第四位［1］.我国每年新诊断的HCC患者约46.61万例,每年大概有42.21万例患者死于HCC,发病及死亡人数均接近世界的一半［2］ ...

本文是Radiomics领域里程碑式文章,有Radiomics"开山之作"之称,最早提出Radiomics概念,文章虽然很简短,但系统介绍了方法体系的背景.流程.假设(理论基础). ...

这两天"王院长"帮别人分析snv数据,顺便给我推荐了一个R包:maftools.我看了一下官网,感觉是个非常强大的R包.那必须要学习起来~实际上网上已经有很多教程了,但都是用maf ...

细胞疯狂生长是肿瘤的共同特征之一,为了有效提供细胞疯狂生长所需的大量能量和大分子,肿瘤需要对细胞代谢和微环境进行重新编程.不过,肿瘤对葡萄糖.脂肪酸和谷氨酰胺等主要能量来源的依赖和利用存在差异,这与基 ...

MATH值代表的肿瘤异质性在乳腺癌与生存关系不显著但是作者后续的分析,只挑选了more functional (MF) mutations, 就是那些被PolyPhen-2软件认定为是"p ...

前面我们看的文章都是说肿瘤异质性显著影响病人生存,而且MATH值很可靠,今天分享的发表在 Sci Rep. 2018 Jul 的文章就是来啪啪啪打脸的. MATH值代表的肿瘤异质性在乳腺癌与生存关系不 ...

前面我们说到文章 Oncotarget. 2016 Mar 使用pyclone计算的克隆数量来代表肿瘤异质性,发现肿瘤内部异质性在不同癌症里面都显著影响生存. 但是今天要分享的文章Breast Can ...

为了分析不同类型.组织起源肿瘤的共性.差异以及新课题.TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹,加州举行的会议中发起了泛癌计划.参考:https://www.ncbi.nlm.nih.gov ...

为了分析不同类型.组织起源肿瘤的共性.差异以及新课题.TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹,加州举行的会议中发起了泛癌计划.参考:https://www.ncbi.nlm.nih.gov ...

作者简介邱立新,就职于复旦大学附属肿瘤医院肿瘤内科.主要从事胃癌.肠癌等恶性肿瘤的化疗.靶向治疗.免疫治疗和研究.创办了肿瘤科普公众号"邱立新医生(qiulixinyisheng)&quo ...

文章来自<并行计算:结构.算法.编程>,内容覆盖并行计算与并行计算机结构模型.并行计算机系统互连与基本通信操作.典型并行计算机系统介绍,以及并行计算性能评测,由于篇幅所限,以下为部分内容. ...

package cn.itcast.tags.ml.classification import org.apache.spark.ml.Pipeline import org.apache.spark ...

循心电踪迹,探心脏奥秘! 杂志君小芯,在此恭候! 作者:黎明,张宇霞,蔡卫卫,胡传言, 卢海涛作者单位:深圳市宝安中医院(集团)心功能科左右都可以滑动打开心扉引用格式: 黎明,张宇霞,蔡卫卫 ...

使用Mutant-allele tumor heterogeneity(MATH)算法评估肿瘤异质性